Ve Spojených státech O’Mahonyho předsednictví nad Fenianským bratrstvem stále více zpochybňoval William R. Roberts. Obě feniánské frakce získávaly peníze vydáváním dluhopisů ve jménu „Irské republiky“, které kupovali věřící v očekávání, že budou honorovány, až bude Irsko „opět národem“. Tyto dluhopisy měly být vyplaceny „šest měsíců po uznání nezávislosti Irska“. Předplatily si je statisíce irských přistěhovalců.
Nakoupilo se velké množství zbraní a Robertsova frakce se otevřeně připravovala na koordinovanou sérii nájezdů do Kanady, kterým vláda Spojených států nepodnikla žádné zásadní kroky, aby jim zabránila. Mnozí členové americké administrativy nebyli tomuto hnutí nakloněni, protože Velká Británie nepodpořila Unii během občanské války. Robertsovým „válečným tajemníkem“ byl generál T. W. Sweeny, který byl od ledna 1866 do listopadu 1866 vyškrtnut ze seznamu americké armády, aby mohl nájezdy organizovat. Účelem těchto nájezdů bylo zmocnit se dopravní sítě v Kanadě s tím, že to Brity donutí vyměnit svobodu Irska za vlastnictví jejich provincie Kanada. Před invazí získali feniáni určité informace od podobně smýšlejících stoupenců v Kanadě, ale nezískali podporu všech tamních irských katolíků, kteří v invazích viděli ohrožení vznikající kanadské suverenity.
V dubnu 1866 dorazila pod velením Johna O’Mahonyho skupina více než 700 členů Fenianského bratrstva k pobřeží Maine naproti ostrovu s úmyslem zmocnit se Campobella od Britů. Britské válečné lodě z Halifaxu v Novém Skotsku byly rychle na místě a vojenská jednotka feniány rozprášila. Tato akce posloužila k posílení myšlenky ochrany Nového Brunšviku spojením s britskými severoamerickými koloniemi Nové Skotsko, Východní Kanada a Západní Kanada v konfederaci a vytvořením Kanadského dominia.
Velením výpravy v Buffalu ve státě New York pověřil Roberts plukovníka Johna O’Neilla, který v noci z 31. května na 1. června 1866 překročil v čele nejméně 800 (O’Neillův údaj; v kanadských pramenech se obvykle uvádí až 1 500) mužů řeku Niagaru (Niagara je mezinárodní hranice), krátce se zmocnil pevnosti Fort Erie a porazil kanadské jednotky u Ridgeway. Mnozí z těchto mužů, včetně O’Neilla, byli ostřílení veteráni americké občanské války. Invaze byla nakonec přerušena následným přerušením feniánských zásobovacích tras přes řeku Niagaru americkými úřady a zatčením feniánských posil, které se pokoušely překročit řeku do Kanady. Je nepravděpodobné, že by s tak malými silami vůbec dosáhli svého cíle.
K dalším fénianským pokusům o invazi docházelo během následujícího týdne v údolí svatého Vavřince. Protože mnoho zbraní bylo mezitím zabaveno americkou armádou, poměrně málo z nich se skutečně zapojilo do bojů. Dokonce došlo k malému nájezdu Fenianů na skladiště, při kterém se podařilo získat zpět některé zbraně zabavené americkou armádou. Mnohé z nich byly nakonec sympatizujícími důstojníky stejně vráceny.
Aby vláda USA dostala Feniany z oblasti Svatého Vavřince i z Buffala, zakoupila pro ně železniční jízdenky, aby se mohli vrátit do svých domovů, pokud dotyční slíbí, že už nebudou napadat další země ze Spojených států. Mnohé zbraně byly později vráceny, pokud osoba, která se o ně přihlásila, mohla složit záruku, že nebudou znovu použity k invazi do Kanady, ačkoli některé z nich byly pravděpodobně použity při následných nájezdech.
V prosinci 1867 se O’Neill stal předsedou Robertsovy frakce Fenianského bratrstva, která v následujícím roce uspořádala ve Filadelfii velký sjezd za účasti více než 400 řádně akreditovaných delegátů, zatímco ulicemi defilovalo 6 000 ozbrojených a uniformovaných feniánských vojáků. Na tomto sjezdu se zrodila myšlenka druhé invaze do Kanady. Zpráva o výbuchu v Clerkenwellu byla silným podnětem k razantní politice. Henri Le Caron, který v době, kdy působil jako tajný agent britské vlády, zastával funkci „generálního inspektora Irské republikánské armády“, tvrdí, že v rámci příprav na zamýšlený vpád rozdal patnáct tisíc stánků se zbraněmi a téměř tři miliony nábojů do péče mnoha důvěrníků rozmístěných mezi Ogdensburgem v New Yorku a St. Albans ve Vermontu. Ten se uskutečnil v dubnu 1870 a ukázal se být stejně rychlým a úplným neúspěchem jako pokus z roku 1866. Feniáni pod O’Neillovým velením překročili kanadskou hranici poblíž Franklinu ve Vermontu, ale byli rozprášeni jedinou salvou kanadských dobrovolníků. Sám O’Neill byl okamžitě zatčen americkými úřady jednajícími na příkaz prezidenta Ulyssese S. Granta.
Po odstoupení z funkce předsedy Fenianského bratrstva se John O’Neill v roce 1871 neúspěšně pokusil o nesankcionovaný vpád a spojil síly svých zbývajících feniánských stoupenců s exilovými členy povstání u Červené řeky. Přepadová skupina překročila hranice Manitoby u města Pembina v území Dakota a zmocnila se obchodní stanice Hudson’s Bay Company na kanadské straně. Američtí vojáci z pevnosti v Pembině se svolením kanadského úředníka Gilberta McMickena překročili hranici do Kanady a feniánské nájezdníky bez odporu zatkli.
Feniánská hrozba vyvolala volání po kanadské konfederaci. Na konfederaci se pracovalo již několik let, ale uskutečnila se až v roce 1867, tedy v roce následujícím po prvních nájezdech. V roce 1868 zavraždil v Ottawě sympatizant feniánů irsko-kanadského politika Thomase D’Arcyho McGeeho za to, že odsoudil nájezdy.
Obavy z útoku feniánů sužovaly v 80. letech 19. století Dolní pevninu Britské Kolumbie, protože Feniánské bratrstvo se aktivně organizovalo ve Washingtonu a Oregonu, ale nájezdy se ve skutečnosti nikdy neuskutečnily . Při slavnostním otevření hlavní trati kanadské pacifické železnice v roce 1885 ukazují fotografie pořízené při této příležitosti tři velké britské válečné lodě sedící v přístavu těsně u železniční stanice a jejích doků. Důvodem jejich přítomnosti byla výslovně hrozba feniánského útoku nebo terorismu, stejně jako velký počet vojáků v prvním vlaku.
.