Přestože citlivost a specifičnost Dukeových kritérií pro diagnózu infekční endokarditidy (IE) byla ověřena vyšetřovateli z Evropy a Spojených států, zůstává několik nedostatků tohoto schématu. Dukeova databáze IE obsahuje záznamy prospektivně shromážděné o >800 případech definitivní a možné IE od roku 1984. Vedeny jsou také databáze o echokardiogramech a o pacientech s bakteriemií Staphylococcus aureus v Duke University Medical Center. Analýzy těchto databází, naše zkušenosti s Dukeovými kritérii v klinické praxi a analýza prací ostatních nás vedly k návrhu následujících modifikací Dukeova schématu. Kategorie „možná IE“ by měla být definována jako kategorie, která má alespoň 1 hlavní kritérium a 1 vedlejší kritérium nebo 3 vedlejší kritéria. Vedlejší kritérium „echokardiogram odpovídající IE, ale nesplňující hlavní kritérium“ by mělo být vzhledem k rozšířenému používání transezofageální echokardiografie (TEE) zrušeno. Bakteriemie způsobená S. aureus by měla být považována za hlavní kritérium bez ohledu na to, zda je infekce získaná nozokomiálně nebo zda je přítomen odstranitelný zdroj infekce. Pozitivní sérologie na Q-horečku by měla být změněna na hlavní kritérium.