Hloubky Secchiho disku je dosaženo, když se odrazivost rovná intenzitě světla zpětně rozptýleného od vody. Tato hloubka v metrech vydělená koeficientem 1,7 dává koeficient útlumu (nazývaný také koeficient extinkce), pro dostupné světlo zprůměrované přes hloubku Secchiho disku. Zatímco se používá jako proměnná, používá se koeficient extinkce také jako proměnná pro zákal. Koeficient zeslabení světla, k, lze pak použít ve formě Beerova-Lambertova zákona,
I z I 0 = e – k z {\displaystyle {I_{z} \over I_{0}}=e^{-kz}}
k odhadu Iz, intenzity světla v hloubce z, z I0, intenzity světla na hladině oceánu.
Odčítání Secchiho disku neposkytuje přesnou míru průhlednosti, protože může docházet k chybám kvůli odleskům slunce na vodě, nebo jedna osoba může vidět disk v jedné hloubce, ale jiná osoba s lepším zrakem ho může vidět ve větší hloubce. Jedná se však o levnou a jednoduchou metodu měření průhlednosti vody. Vzhledem k možnosti rozdílů mezi jednotlivými uživateli by měly být metody co nejvíce standardizovány.
Měření Secchiho diskem by mělo být vždy prováděno u stinné strany lodi nebo mola mezi 9:00 a 15:00 hodinou. Období pro dosažení nejlepších výsledků je mezi 10:00 a 14:00. Měření hloubky Secchiho disku by měl pokaždé provádět stejný pozorovatel stejným způsobem. K měření lze přistoupit tak, že se disk spustí za bod zmizení, pak se zvedne a mírně spustí, aby se nastavila Secchiho hloubka. Další metodou je zaznamenat hloubku, ve které disk zmizí, spustit jej o několik metrů níže a poté zaznamenat hloubku, ve které se disk znovu objeví, když se pomalu zvedá. Secchiho hloubka se stanoví jako průměr těchto dvou hodnot.
Měření Secchiho disku je již nějakou dobu nedílnou součástí programů hodnocení kvality vody v jezerech v Minnesotě a Wisconsinu; obyvatelé jezer provádějí pravidelná měření a své údaje předkládají státním a místním úřadům. Souhrnné podélné údaje se používají k odhalení obecných trendů v kvalitě vody. Podobně program Čistá jezera v Indianě školí dobrovolníky a spoléhá se na ně při sledování zákalu ve více než 80 jezerech v Indianě pomocí Secchiho disků a využívá data zaslaná dobrovolníky ke sledování kvality jezer ve státě.
V roce 2013 založil tým mořských vědců celosvětový vědecký program Secchiho disků pro občany, kteří studují mořský fytoplankton. Tato probíhající studie občanské vědy Secchiho disk kombinuje tradiční obyčejný bílý mořský Secchiho disk o průměru 30 cm s mobilní technologií, která umožňuje odesílat údaje o hloubce Secchiho disku získané z moře do centrální databáze. První vědecké výsledky studie byly zveřejněny v roce 2017. Studie Secchiho disku byla zahájena v reakci na kontroverzní vědeckou zprávu, která naznačovala, že fytoplankton, který ovlivňuje průhlednost vody, se v oceánech mezi lety 1950 a 2008 snížil o 40 %
.