Zahlreiche Kirchen und Gruppen entstanden innerhalb der Bewegung des Neuen Denkens. Emma Curtis Hopkins wird die „Lehrerin der Lehrer“ genannt, weil sie so viele Menschen unterrichtete, die später Gruppen innerhalb der New Thought Bewegung gründeten. Nachdem sie von Hopkins gelernt hatte, gründete Annie Rix Militz das Home of Truth. Eine weitere Schülerin, Malinda E. Cramer, wurde Mitbegründerin von Divine Science, zusammen mit Mrs. Bingham, die später Nona L. Brooks unterrichtete, die Divine Science zusammen mit Cramer gründete. Charles und Myrtle Fillmore, die zusammen bei Hopkins studierten, gründeten später die Unity School of Christianity. Auch Autoren lernten bei Hopkins, darunter Dr. H. Emilie Cady, Autorin des Unity-Lehrbuchs Lessons in Truth, Ella Wheeler Wilcox, Dichterin des Neuen Denkens, und Elizabeth Towne. Wesentlich später Ernest Holmes, der die Religionswissenschaft begründete und die Vereinigten Zentren für spirituelles Leben gründete.
Die Unity Church ist heute die größte New Thought-Kirche mit Tausenden von Mitgliedern in aller Welt. Sie wurde 1891 von den Fillmores gegründet. Divine Science wurde ebenfalls im späten 19. Jahrhundert von Melinda Cramer und Nona Brooks gegründet. Die Vereinigten Zentren für spirituelles Leben wurden 1927 von Ernest Holmes gegründet. Eine ähnliche Organisation, die Society for Jewish Science, wurde ursprünglich von Rabbi Alfred G. Moses in den frühen 1900er Jahren konzipiert und 1922 von Rabbi Morris Lichtenstein institutionalisiert. Die New-Thought-Bewegung erstreckt sich über die ganze Welt. Die größte Glaubensgemeinschaft außerhalb der Vereinigten Staaten, Seicho-no-Ie, wurde 1930 von Masaharu Taniguchi in Japan gegründet. Heute hat sie Missionen auf der ganzen Welt, auch in den USA. Kleinere Kirchen, wie das 1899 in Alameda, Kalifornien, gegründete Home of Truth, bestehen erfolgreich weiter, ebenso wie das Agape International Spiritual Center, eine von Rev. Dr. Michael Beckwith geleitete Megakirche im Großraum Los Angeles.
Eine Vielzahl von Dachorganisationen des Neuen Denkens hat existiert, darunter die International New Thought Alliance, die in irgendeiner Form bereits 1899 bestand. Das Affiliated New Thought Network wurde 1992 gegründet, um eine übergreifende New Thought Organisation zu schaffen. Seit 1974 ist die Universal Foundation for Better Living ein Zusammenschluss von christlichen New Thought-Gemeinden in aller Welt. In New York City gründeten New Thought-Führer eine Dachorganisation namens League for the Larger Life. Sie bestand von 1916 bis in die 1950er Jahre.
Es gab viele Schulen des Neuen Denkens. Die bekannteste dürfte die Unity School of Christianity in Missouri sein, die Anfang des 20. Jahrhunderts gegründet wurde. Das Emerson Theological Institute ist seit 1992 tätig. Um die Jahrhundertwende leitete Horatio Dresser eine Organisation namens School of Applied Metaphysics.
Psychiana war ein von Frank B. Robinson betriebener Versandhandel, der über den U.S. Postal Service New Thought lehrte und verbreitete.