Die Secchi-Tiefe ist erreicht, wenn der Reflexionsgrad gleich der Intensität des vom Wasser zurückgestreuten Lichts ist. Diese Tiefe in Metern geteilt durch 1,7 ergibt einen Abschwächungskoeffizienten (auch Extinktionskoeffizient genannt) für das verfügbare Licht, gemittelt über die Secchi-Scheibentiefe. Der Extinktionskoeffizient wird zwar als Variable verwendet, dient aber auch als Variable für die Trübung. Der Lichtschwächungskoeffizient, k, kann dann in einer Form des Beer-Lambert-Gesetzes verwendet werden,
I z I 0 = e – k z {\displaystyle {I_{z} \über I_{0}}=e^{-kz}}
um Iz, die Lichtintensität in der Tiefe z, aus I0, der Lichtintensität an der Meeresoberfläche, abzuschätzen.
Die Messungen der Secchi-Scheibe liefern kein genaues Maß für die Transparenz, da es aufgrund der Blendung durch die Sonne auf dem Wasser zu Fehlern kommen kann, oder eine Person kann die Scheibe in einer bestimmten Tiefe sehen, eine andere Person mit besserem Sehvermögen sieht sie jedoch in einer größeren Tiefe. Es handelt sich jedoch um eine kostengünstige und unkomplizierte Methode zur Messung der Wasserreinheit. Wegen der möglichen Abweichungen zwischen den Anwendern sollten die Methoden so weit wie möglich standardisiert werden.
Eine Secchi-Scheibenmessung sollte immer von der Schattenseite eines Bootes oder Stegs aus zwischen 9:00 und 15:00 Uhr vorgenommen werden. Die besten Ergebnisse werden zwischen 10:00 und 14:00 Uhr erzielt. Der gleiche Beobachter sollte die Messung der Secchi-Tiefe jedes Mal auf die gleiche Weise durchführen. Man kann sich der Messung nähern, indem man die Scheibe über einen Punkt des Verschwindens hinaus absenkt, sie dann anhebt und leicht absenkt, um die Secchi-Tiefe zu bestimmen. Eine andere Methode besteht darin, die Tiefe zu messen, in der die Scheibe verschwindet, dann einige Meter tiefer zu gehen und dann die Tiefe zu messen, in der die Scheibe wieder auftaucht, während sie langsam hochgefahren wird. Die Secchi-Tiefe wird als Durchschnitt der beiden Werte ermittelt.
Secchi-Scheibenmessungen sind seit einiger Zeit fester Bestandteil der Programme zur Bewertung der Wasserqualität in den Seen von Minnesota und Wisconsin; die Seeanrainer führen regelmäßige Messungen durch und übermitteln ihre Messwerte an die staatlichen und lokalen Behörden. Die aggregierten Längsschnittdaten werden verwendet, um allgemeine Trends in der Wasserqualität aufzuzeigen. In ähnlicher Weise schult das Indiana Clean Lakes Program Freiwillige für die Überwachung der Trübung in über 80 Seen in Indiana mit Hilfe von Secchi-Scheiben und nutzt die von Freiwilligen eingereichten Daten zur Überwachung der Seequalität im Bundesstaat.
Im Jahr 2013 hat ein Team von Meereswissenschaftlern das globale Citizen Science Secchi Disk Programm für Seeleute zur Untersuchung des marinen Phytoplanktons ins Leben gerufen. Diese laufende Citizen-Science-Secchi-Scheiben-Studie kombiniert die traditionelle weiße Secchi-Scheibe mit einem Durchmesser von 30 cm mit mobiler Technologie, um die im Meer gesammelten Daten zur Secchi-Tiefe in eine zentrale Datenbank hochzuladen. Die ersten wissenschaftlichen Ergebnisse der Studie wurden 2017 veröffentlicht. Die Secchi-Disk-Studie wurde als Reaktion auf einen umstrittenen wissenschaftlichen Bericht gestartet, der nahelegte, dass das Phytoplankton, das die Wassertransparenz beeinflusst, in den Ozeanen zwischen 1950 und 2008 um 40 % zurückgegangen war.