Az Egyesült Államokban O’Mahony elnökségét a Fenian Brotherhood felett William R. Roberts egyre inkább megkérdőjelezte. Mindkét fenianista frakció pénzt gyűjtött az “Ír Köztársaság” nevében kibocsátott kötvényekkel, amelyeket a hívek megvásároltak abban a reményben, hogy majd akkor honorálják őket, ha Írország “Ismét egy nemzet lesz”. Ezeket a kötvényeket “Írország függetlenségének elismerése után hat hónappal” kellett visszaváltani. Ír bevándorlók százezrei jegyeztek.
Nagy mennyiségű fegyvert vásároltak, és a Roberts-frakció nyíltan előkészületeket tett a Kanadába irányuló összehangolt rajtaütések sorozatára, amelynek megakadályozására az Egyesült Államok kormánya nem tett jelentősebb lépéseket. Az amerikai kormányzatban sokan nem voltak ellenszenvesek a mozgalom iránt, mivel Nagy-Britannia nem támogatta az Uniót a polgárháború alatt. Roberts “hadügyminisztere” T. W. Sweeny tábornok volt, akit 1866 januárjától 1866 novemberéig töröltek az amerikai hadsereg listájáról, hogy lehetővé tegyék számára a rajtaütések megszervezését. A rajtaütések célja az volt, hogy elfoglalják Kanada közlekedési hálózatát, azzal az elképzeléssel, hogy ez arra kényszeríti a briteket, hogy Írország szabadságát Kanada tartományuk birtoklásáért cserébe elcseréljék. Az inváziót megelőzően a feniek kaptak némi hírszerzési információt Kanadán belül a hasonló gondolkodású támogatóktól, de nem kaptak támogatást az összes ottani ír katolikustól, akik úgy látták, hogy az inváziók veszélyeztetik a kialakulóban lévő kanadai szuverenitást. 1866 áprilisában John O’Mahony parancsnoksága alatt a Fenian Testvériség több mint 700 tagból álló csapata megérkezett a Maine-szigettel szemben lévő partra azzal a szándékkal, hogy Campobello-t elfoglalják a britektől. Az új-skóciai Halifaxból érkező brit hadihajók gyorsan a helyszínre érkeztek, és egy katonai erő szétkergette a feniánusokat. Ez az akció azt a gondolatot erősítette, hogy New Brunswick védelmét az Új-Skócia, Kelet-Kanada és Nyugat-Kanada brit észak-amerikai gyarmatokkal a Konföderációban, a Kanadai Dominiumban való egyesüléssel kívánják biztosítani.
A New York állambeli Buffalóban az expedíció vezetését Roberts John O’Neill ezredesre bízta, aki 1866. május 31-ről június 1-jére virradó éjjel és reggel legalább 800 (O’Neill száma; a kanadai forrásokban általában legfeljebb 1500-ról számolnak be) ember élén átkelt a Niagara folyón (a Niagara a nemzetközi határ), és rövid időre elfoglalta Fort Erie-t, Ridgewaynél legyőzve egy kanadai erőt. E férfiak közül sokan, köztük O’Neill is, az amerikai polgárháború harcedzett veteránjai voltak. Az inváziót végül az törte meg, hogy az amerikai hatóságok ezt követően megszakították a Fenian utánpótlási vonalakat a Niagara folyón keresztül, és letartóztatták a folyón Kanadába átkelni próbáló Fenian-erősítéseket. Nem valószínű, hogy ilyen kis létszámú erővel valaha is elérték volna a céljukat.
A következő héten a Szent Lőrinc-völgyben további Fenian inváziós kísérletek történtek. Mivel sok fegyvert időközben az amerikai hadsereg elkobzott, ezek közül viszonylag kevesen vettek részt ténylegesen a harcokban. Még egy kisebb fenianista rajtaütés is történt egy raktárépület ellen, amelynek során sikeresen visszaszereztek néhány, az amerikai hadsereg által lefoglalt fegyvert. Sokukat végül mégis visszaszolgáltatták a szimpatizáns tisztek.
Azért, hogy a feniek elhagyják a területet, mind a Szent Lőrinc folyónál, mind Buffalóban, az amerikai kormány vasúti jegyeket vásárolt a fenieknek, hogy hazatérhessenek, ha az érintettek megígérik, hogy nem támadnak meg több országot az Egyesült Államokból. Sok fegyvert később visszaszolgáltattak, ha az azokat igénylő személy garanciát tudott vállalni arra, hogy azokat nem fogják újra Kanada lerohanására használni, bár néhányat valószínűleg az ezt követő rajtaütések során használtak fel.
1867 decemberében O’Neill lett a Fenian Brotherhood Roberts-frakciójának elnöke, amely a következő évben Philadelphiában nagyszabású kongresszust tartott, amelyen több mint 400 megfelelően akkreditált küldött vett részt, miközben 6000 felfegyverzett és egyenruhás fenianista katona vonult fel az utcákon. Ezen a gyűlésen fogalmazták meg Kanada második invázióját. A clerkenwelli robbantás híre erőteljes politikára ösztönzött. Henri Le Caron, aki a brit kormány titkos ügynökeként eljárva az “Ír Köztársasági Hadsereg főfelügyelője” tisztséget töltötte be, azt állítja, hogy a New York-i Ogdensburg és a vermonti St. Albans között állomásozó számos megbízható ember gondozásában tizenötezer fegyverállványt és közel hárommillió lőszert osztott szét a tervezett rajtaütés előkészítésére. Erre 1870 áprilisában került sor, és ugyanolyan gyors és teljes kudarcot vallott, mint az 1866-os kísérlet. Az O’Neill parancsnoksága alatt álló feniánusok a vermonti Franklin közelében átlépték a kanadai határt, de a kanadai önkéntesek egyetlen sortűzzel szétoszlatták őket. Magát O’Neillt azonnal letartóztatták az Egyesült Államok hatóságai, Ulysses S. Grant elnök parancsára.
Miután John O’Neill lemondott a Fenian Testvériség elnöki tisztségéről, 1871-ben sikertelenül kísérelt meg egy nem engedélyezett rajtaütést, egyesítve megmaradt Fenian támogatóinak erőit a Red River Rebellion száműzött tagjaival. A portyázó csapat a Dakota Területen található Pembinánál lépte át a határt Manitoba felé, és elfoglalta a Hudson’s Bay Company kereskedelmi állomását a kanadai oldalon. A pembinai erőd amerikai katonái a kanadai tisztviselő, Gilbert McMicken engedélyével átlépték a kanadai határt, és ellenállás nélkül letartóztatták a fenianista portyázókat.
A fenianista fenyegetés hatására a kanadai konföderációt követelték. A konföderáció már évek óta tervben volt, de csak 1867-ben, az első portyákat követő évben valósult meg. 1868-ban egy Fenian szimpatizáns meggyilkolta Thomas D’Arcy McGee ír-kanadai politikust Ottawában, amiért elítélte a razziákat.
A Fenian támadástól való félelem az 1880-as években Brit Columbia alsó-fennsíkját sújtotta, mivel a Fenian Testvériség aktívan szervezkedett Washingtonban és Oregonban, de a razziák valójában soha nem valósultak meg . A Canadian Pacific Railway fővonalának 1885-ös felavatásán az erről az alkalomról készült fényképeken három nagy brit hadihajó látható a kikötőben, közvetlenül a vasútállomás és a dokkok előtt. Jelenlétüket kifejezetten a fenianusok támadásának vagy terrorizmusának veszélye indokolta, akárcsak az első vonaton utazó nagyszámú katonaságot.