A PUE-mérőszám a legnépszerűbb módszer az energiahatékonyság kiszámítására. Bár más mérőszámokkal összehasonlítva ez a leghatékonyabb, az energiafelhasználás hatékonyságának megvannak a maga hibái. Ez a leggyakrabban használt metrika az üzemeltetők, létesítmény-technikusok és épületépítészek számára annak meghatározására, hogy mennyire energiahatékonyak az adatközpontok épületei. Egyes szakemberek még azzal is dicsekednek, hogy a teljesítményfelhasználási hatékonyságuk alacsonyabb, mint másoké. Természetesen nem meglepő, hogy egyes esetekben az üzemeltető “véletlenül” nem számolja a világításra felhasznált energiát, ami alacsonyabb energiafelhasználási hatékonyságot eredményez. Ez a probléma inkább emberi hibához kapcsolódik, mint magával a teljesítményfelhasználási hatékonyság mérőrendszerével kapcsolatos problémához.
Az egyik valódi probléma az, hogy a PUE nem veszi figyelembe a városok éghajlatát, ahol az adatközpontok épülnek. Különösen nem veszi figyelembe a különböző normál hőmérsékleteket az adatközponton kívül. Például egy Alaszkában található adatközpontot nem lehet hatékonyan összehasonlítani egy Miamiban található adatközponttal. A hidegebb éghajlat kisebb szükségletet eredményez a masszív hűtőrendszerre. A hűtőrendszerek a létesítményben felhasznált energia nagyjából 30 százalékát teszik ki, míg az adatközpont berendezései közel 50 százalékát. Emiatt a miami adatközpont végső energiafelhasználási hatékonysága 1,8, az alaszkai adatközponté pedig 1,7 lehet, de a miami adatközpont összességében hatékonyabban működik. Különösen, ha történetesen Alaszkában van, akkor jobb eredményt érhet el.”
A Science Direct egyik esettanulmánya szerint ráadásul “a becsült PUE gyakorlatilag értelmetlen, hacsak az informatika nem működik teljes kapacitással.”
Összességében nagyon fontos, hogy megtaláljuk az olyan egyszerű, de visszatérő problémákat, mint a városokban változó hőmérséklet hatásával kapcsolatos problémák, és megtanuljuk, hogyan kell helyesen kiszámítani az összes létesítmény energiafogyasztását. Ezáltal a problémák folyamatos csökkentése biztosítja, hogy a további előrelépés és a magasabb szabványok mindig a jövőbeni adatközpont-létesítmények energiafelhasználási hatékonyságának sikerét javítják.
A hatékonysági számítás pontos eredményeinek eléréséhez az adatközponthoz kapcsolódó összes adatot be kell vonni. Már egy apró hiba is sok különbséget okozhat a PUE-eredményekben. A tipikusan adatközpontokban gyakran észlelt gyakorlati probléma közé tartozik az adatközponttal párhuzamosan futó alternatív energiatermelő rendszerek (például szélturbinák és napelemek) energiaadottságának hozzáadása a PUE-hoz, ami az adatközpont valódi teljesítményének elhomályosításához vezet. Egy másik probléma az, hogy egyes energiafogyasztó és az adatközponthoz kapcsolódó eszközök valójában megosztják az energiát vagy máshol használják, ami hatalmas hibát okoz a PUE-nál.