W Stanach Zjednoczonych prezydentura O’Mahony’ego nad Bractwem Fenian była coraz bardziej kwestionowana przez Williama R. Robertsa. Obie frakcje Fenian gromadziły pieniądze poprzez emisję obligacji w imieniu „Republiki Irlandzkiej”, które były kupowane przez wiernych w nadziei, że będą honorowane, gdy Irlandia stanie się „Narodem raz jeszcze”. Obligacje te miały być wykupione „sześć miesięcy po uznaniu niepodległości Irlandii”. Setki tysięcy irlandzkich imigrantów zapisało się na nie.
Duże ilości broni zostały zakupione, a frakcja Robertsa otwarcie poczyniła przygotowania do skoordynowanej serii najazdów na Kanadę, którym rząd Stanów Zjednoczonych nie podjął większych kroków, by zapobiec. Wielu w amerykańskiej administracji nie było obojętnych wobec tego ruchu z powodu niepowodzenia Wielkiej Brytanii we wspieraniu Unii podczas wojny domowej. Sekretarzem wojny” Robertsa był generał T. W. Sweeny, który został skreślony z listy armii amerykańskiej od stycznia 1866 roku do listopada 1866 roku, aby umożliwić mu zorganizowanie nalotów. Celem tych najazdów było przejęcie sieci transportowej Kanady, z myślą, że zmusi to Brytyjczyków do wymiany wolności Irlandii na posiadanie ich prowincji Kanady. Przed inwazją Fenian otrzymali pewne informacje wywiadowcze od podobnie myślących zwolenników w Kanadzie, ale nie otrzymali wsparcia od wszystkich tamtejszych irlandzkich katolików, którzy widzieli inwazje jako zagrożenie dla rodzącej się kanadyjskiej suwerenności.
W kwietniu 1866 roku, pod dowództwem Johna O’Mahony’ego, grupa ponad 700 członków Bractwa Fenian przybyła na wybrzeże Maine naprzeciwko wyspy z zamiarem zajęcia Campobello od Brytyjczyków. Brytyjskie okręty wojenne z Halifaxu w Nowej Szkocji szybko pojawiły się na miejscu, a siły wojskowe rozproszyły Fenian. Ta akcja posłużyła do wzmocnienia idei ochrony Nowego Brunszwiku poprzez połączenie się z brytyjskimi koloniami północnoamerykańskimi Nowej Szkocji, Kanady Wschodniej i Kanady Zachodniej w Konfederacji, tworząc Dominium Kanady.
Inne próby inwazji podejmowane przez Fenicjan miały miejsce w ciągu następnego tygodnia w Dolinie Świętego Wawrzyńca. Ponieważ wiele z broni zostało w międzyczasie skonfiskowanych przez armię amerykańską, stosunkowo niewielu z tych ludzi zaangażowało się w walkę. Odbył się nawet mały najazd Fenian na magazyn, w którym udało się odzyskać część broni skonfiskowanej przez armię amerykańską. W celu pozbycia się Fenian z tego obszaru, zarówno w rejonie St. Lawrence jak i Buffalo, rząd amerykański zakupił bilety kolejowe dla Fenian, aby mogli oni powrócić do swoich domów, jeśli osoby zaangażowane w ten proceder obiecałyby, że nie będą najeżdżać więcej krajów ze Stanów Zjednoczonych. Wiele z tych broni zostało później zwróconych, jeśli osoba żądająca ich zwrotu mogła złożyć gwarancję, że nie zostaną one użyte do ponownej inwazji na Kanadę, chociaż niektóre z nich mogły zostać użyte w kolejnych najazdach. W grudniu 1867 roku O’Neill został prezydentem frakcji Robertsa w Bractwie Fenian, które w następnym roku zorganizowało wielką konwencję w Filadelfii z udziałem ponad 400 odpowiednio akredytowanych delegatów, podczas gdy 6,000 uzbrojonych i umundurowanych żołnierzy Fenian paradowało po ulicach. Na tej konwencji wymyślono drugą inwazję na Kanadę. Wiadomość o eksplozji w Clerkenwell była silnym bodźcem do energicznej polityki. Henri Le Caron, który działając jako tajny agent rządu brytyjskiego, piastował stanowisko „Inspektora Generalnego Irlandzkiej Armii Republikańskiej”, zapewnia, że w ramach przygotowań do zamierzonego najazdu rozdał piętnaście tysięcy stojaków z bronią i prawie trzy miliony sztuk amunicji pod opieką wielu zaufanych ludzi stacjonujących między Ogdensburgiem w Nowym Jorku a St. Albans w stanie Vermont. Odbył się on w kwietniu 1870 roku i okazał się porażką tak samo szybką i całkowitą jak próba z 1866 roku. Fenicjanie pod dowództwem O’Neilla przekroczyli granicę kanadyjską w pobliżu Franklin, Vermont, ale zostali rozproszeni pojedynczą salwą kanadyjskich ochotników. Sam O’Neill został natychmiast aresztowany przez władze Stanów Zjednoczonych działające na polecenie prezydenta Ulyssesa S. Granta.
Po rezygnacji z funkcji prezesa Bractwa Fenian, John O’Neill bezskutecznie próbował dokonać niesankcjonowanego najazdu w 1871 roku, łącząc siły pozostałych zwolenników Fenian z wygnanymi członkami Red River Rebellion. Grupa najeźdźców przekroczyła granicę z Manitobą w Pembina, Terytorium Dakoty i zajęła posterunek handlowy Hudson’s Bay Company po stronie kanadyjskiej. Amerykańscy żołnierze z fortu w Pembina, za zgodą kanadyjskiego urzędnika Gilberta McMickena, przekroczyli granicę z Kanadą i aresztowali Fenian raiders bez oporu. Konfederacja była w planach od lat, ale została wprowadzona w życie dopiero w 1867 roku, rok po pierwszych najazdach. W 1868 roku sympatyk Fenian zamordował irlandzko-kanadyjskiego polityka Thomasa D’Arcy McGee w Ottawie za jego potępienie najazdów.
Obawa przed atakiem Fenian nękała Lower Mainland w Kolumbii Brytyjskiej w latach 80-tych XIX wieku, jako że Bractwo Fenian aktywnie organizowało się w Waszyngtonie i Oregonie, ale najazdy nigdy się nie zmaterializowały. Podczas inauguracji głównej linii kolejowej Canadian Pacific Railway w 1885 roku, na zdjęciach zrobionych z tej okazji widać trzy duże brytyjskie okręty wojenne siedzące w porcie tuż przy głowicy kolejowej i jej dokach. Ich obecność była wyraźnie spowodowana groźbą ataku Fenian lub terroryzmu, podobnie jak duża liczba żołnierzy w pierwszym pociągu.
.