Klonorchiasis jest chorobą pasożytniczą o dużym znaczeniu dla zdrowia publicznego w wielu krajach południowo-wschodniej Azji i jest wywoływana przez chińską motylicę wątrobową Clonorchis sinensis. Jednakże, struktura genetyczna i historia demograficzna jej populacji nie została wystarczająco zbadana w całym zasięgu geograficznym gatunku, a dostępne dane opierają się głównie na częściowym sekwencjonowaniu genów. W niniejszej pracy po raz pierwszy zbadaliśmy różnorodność genetyczną kompletnej sekwencji 1560 bp genu podjednostki 1 oksydazy cytochromu c (cox1) w izolowanych geograficznie populacjach C. sinensis w Rosji i Wietnamie. Uzyskane wyniki wykazały niskie zróżnicowanie nukleotydowe i wysokie zróżnicowanie haplotypowe w obrębie i pomiędzy dwoma porównywanymi regionami oraz wyraźny wektor geograficzny dla rozmieszczenia wzorców różnorodności genetycznej wśród badanych populacji. Wyniki te sugerują głęboką lokalną adaptację pasożyta do środowiska, w tym do żywicieli pośrednich oraz istnienie przepływu genów w całym zasięgu gatunku. Dodatkowo, przewidzieliśmy substytucję aminokwasową w miejscu funkcjonalnym białka COX1 w populacjach wietnamskich, które okazały się trudne do leczenia prazykwantelem. Sieci haplotypów składały się z kilku specyficznych dla regionu linii filogenetycznych, których powstawanie mogło mieć miejsce podczas najbardziej rozległych przedostatnich zlodowaceń w epoce plejstocenu. Wzorce różnorodności genetycznej i demografii są zgodne ze wzrostem populacji motylicy wątrobowej w późnym plejstocenie po Ostatnim Maksimum Lodowcowym, wskazując na brak wąskiego gardła populacji w nieodległej przeszłości w historii gatunku. Uzyskane dane mają ważne implikacje dla zrozumienia filogeografii C. sinensis, jego interakcji żywiciel-pasożyt, zdolności tego pasożyta do ewolucji oporności na leki oraz epidemiologii klonorchiazy w warunkach globalnych zmian klimatycznych.
