Opis
Promotory T7 mogą wytwarzać wysoki poziom transkrypcji w E. coli, gdy obecna jest T7 RNAP. Drugą zaletą promotorów T7 jest to, że nie są one rozpoznawane przez RNAP E. coli, co czyni promotory T7 zdolnymi do niezależnej regulacji od promotorów E. coli. Ponieważ aktywny, silny promotor T7 może całkowicie zatrzymać wzrost E. coli z powodu wysokiego poziomu zużycia zasobów (np. nukleotydów) przez T7 RNAP, zwykle konieczne jest regulowanie poziomu albo T7 RNAP, albo promotora T7, albo obu. Rodzina promotorów T7 zawiera zarówno promotory konstytutywne, jak i negatywnie regulowane promotory, które mogą być wyłączone przez białko represorowe. Najbardziej powszechnym szczepem komórkowym używanym z systemem promotora T7 jest BL21(DE3), który jest szczepem E. coli B zawierającym lizogen λ z indukowalnym genem T7 RNAP na chromosomie. Jednakże, możliwe jest zaprojektowanie wielu innych szczepów E. coli do warunkowej ekspresji T7 RNAP.
Otrzymywanie kolekcji promotorów T7
Sekwencje promotorów T7 można znaleźć w poniższej tabeli. Aby uzyskać fizyczne DNA, zalecamy dwa podejścia –
Via synteza de novo: Ponieważ promotory są stosunkowo krótkimi sekwencjami, można je zamówić jako dwa jednoniciowe nakładające się oligo są annealowane i przedłużane w celu skonstruowania pełnych promotorów. Zobacz ten protokół OpenWetWare, jak konstruować części przez annealowanie i przedłużanie oligo. Alternatywnie promotory można zamówić jako krótkie geny z firmy takiej jak Geneart.
Przez dystrybucję Registry: Niektóre z promotorów są dostępne w bieżącej dystrybucji rejestru, patrz kolumna dostępność w poniższej tabeli.
Projektowanie & Konstruowanie
Logo sekwencyjne silnych promotorów z genomu bakteriofaga T7.
Promotory T7 w kolekcji zostały zaprojektowane i skonstruowane przez kilka różnych grup. Jednakże istnieje tylko T7 RNAP, a więc tylko jeden rodzaj promotora T7. Sekwencja konsensusu dla promotorów T7 może być wywnioskowana z logo sekwencji dla promotorów T7 pokazanych po prawej stronie.
Kolekcja promotorów T7
Name | Description | Promoter Sequence | Positive Regulators |
Negative Regulators |
Długość | Doc | Status | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
BBa_I712074 | Promotor T7 (silny promotor z bakteriofaga T7) | . . . agggaatacaagctacttgttctttgca | 46 | 1938 | In stock | |||
BBa_I719005 | T7 Promotor | taatacgactcactatagggaga | 23 | 7912 | Na stanie | |||
BBa_J34814 | T7 Promotor | gaatttaatacgactcactatagggaga | 28 | 1190 | Not in stock | |||
BBa_J64997 | T7 consensus -.10 i reszta | taatacgactcactatagg | 19 | 10154 | To skomplikowane | |||
BBa_K113010 | nakładający się promotor T7 | . . gagtcgtattaatacgactcactatagggg | 40 | 1553 | To skomplikowane | |||
BBa_K113011 | bardziej nakładający się promotor T7 | . . agtgagtcgtactacgactcactatagggg | 37 | 1601 | To skomplikowane | |||
BBa_K113012 | osłabiony nakładający się promotor T7 | . gagtcgtattaatacgactctctatagggg | 40 | 1630 | To skomplikowane | |||
BBa_K1614000 | Promotor T7 dla ekspresji funkcjonalnego RNA | taatacgactcactatag | 18 | 5219 | In stock | |||
BBa_K3511008 | C62-.Promotor T7 | taatacgactcacaatcgcggag | 23 | |||||
BBa_K3633015 | Promotor T7 | taatacgactcactatagg | 19 | To skomplikowane | ||||
BBa_K525998 | Promotor T7 i RBS | . . . atacgactcactatagggaaaggagaaa | 32 | 3036 | W magazynie | |||
BBa_R0085 | Sekwencja promotorowa konsensusu T7 | taatacgactcactatagggaga | 23 | 2072 | In stock | |||
BBa_R0180 | Promotor T7 RNAP | ttatacgactcactatagggaga | 23 | 1654 | Not in stock | |||
BBa_R0181 | T7 RNAP promotor | gaatacgactcactatagggaga | 23 | 1651 | Brak w magazynie | |||
BBa_R0182 | T7 RNAP promotor | taatacgtctcactatagggaga | 23 | 1653 | Nie występuje w magazynie | |||
BBa_R0183 | Promotor T7 RNAP | tcatacgactcactatagggaga | 23 | 1653 | Not in stock | |||
BBa_R0184 | Promotor T7 (lacI repressible) | . . ataggggaattgtgagcggataacaattcc | 44 | 1176 | Not in stock | |||
BBa_R0185 | T7 promotor (lacI repressible) | . . ataggggaattgtgagcggataacaattcc | 44 | 1888 | Not in stock | |||
BBa_R0186 | T7 promotor (lacI repressible) | . ataggggaattgtgagcgataacaattcc | 44 | 1885 | Not in stock | |||
BBa_R0187 | T7 promotor (lacI repressible) | . . ataggggaattgtgagcgataacaattcc | 44 | 1885 | Not in stock | |||
BBa_Z0251 | T7 strong promotor | . . taatacgactcactataggagaccacaac | 35 | 1887 | Not in stock | |||
BBa_Z0252 | T7 weak binding and processivity | . taattgaactcactaaaggagcaccacagc | 35 | 1667 | Not in stock | |||
BBa_Z0253 | T7 słabe wiązanie promotora | . . cgaagtaatacgactcactattagggaaga | 35 | 1400 | Brak w magazynie |
.