Dzięki unikalnemu podejściu opartemu na badaniach, wykorzystującemu najbardziej zaawansowany sprzęt techniczny, Franck Goddio i jego zespół, we współpracy z egipską Najwyższą Radą Starożytności, byli w stanie zlokalizować, zmapować i odkopać części miasta Thonis-Heracleion, które leży 6,5 kilometra od dzisiejszej linii brzegowej. Miasto znajduje się na obszarze badań o wymiarach 11 na 15 kilometrów, w zachodniej części Zatoki Aboukir, na głębokości około 10 metrów. Badania rozpoczęły się w 1996 roku. Mapowanie całego obszaru zajęło wiele lat. Pierwszych odkryć można było dokonać w 2000 roku. Franck Goddio odnalazł ważne informacje na temat starożytnych zabytków Thonis-Heracleion, takich jak wielka świątynia Amona i jego syna Khonsou (Herakles dla Greków), portów, które niegdyś kontrolowały cały handel do Egiptu, oraz życia codziennego mieszkańców. Rozwiązał on również historyczną zagadkę, która przez lata zastanawiała egiptologów: materiał archeologiczny ujawnił, że Heracleion i Thonis były w rzeczywistości jednym i tym samym miastem o dwóch nazwach; Heracleion to nazwa miasta dla Greków, a Thonis dla Egipcjan.
Jak wyglądało miasto
Przedmioty odzyskane z wykopalisk ilustrują piękno i chwałę miast, wspaniałość ich wielkich świątyń i obfitość historycznych dowodów: kolosalne posągi, inskrypcje i elementy architektoniczne, biżuteria i monety, przedmioty rytualne i ceramika – cywilizacja zastygła w czasie.
Ilość i jakość materiału archeologicznego wydobytego z terenu Thonis-Heracleion pokazują, że to miasto znało czas bogactwa i szczytowy okres okupacji od 6 do 4 wieku p.n.e.. Jest to łatwo widoczne w dużej ilości monet i ceramiki datowanych na ten okres. Port w Thonis-Heracleion posiadał liczne duże baseny i funkcjonował jako centrum handlu międzynarodowego. Intensywna działalność w porcie sprzyjała dobrobytowi miasta. Ponad siedemset starożytnych kotwic o różnych formach i ponad 70 wraków pochodzących z 6 do 2 wieku p.n.e. są również wymownym świadectwem intensywności działalności morskiej w tym miejscu.
Miasto rozciągało się wokół świątyni, a sieć kanałów w mieście i wokół niego musiała nadać mu wygląd mieszkania nad jeziorem. Na wyspach i wysepkach znajdowały się domy mieszkalne i drugorzędne sanktuaria. Wykopaliska tutaj ujawniły piękne materiały archeologiczne, takie jak statuetki z brązu. Po północnej stronie świątyni Heraklesa, wielki kanał przepływał przez miasto ze wschodu na zachód i łączył baseny portowe z jeziorem na zachodzie.
Podwodne badania archeologiczne w Thonis-Heracleion trwają do dziś. Franck Goddio szacuje, że tylko 5 procent miasta zostało jeszcze odkryte.
.