Clonorcoza este o boală parazitară de mare importanță pentru sănătatea publică în multe țări din sud-estul Asiei și este cauzată de fluviul hepatic chinezesc Clonorchis sinensis. Cu toate acestea, structura genetică și istoricul demografic al populațiilor sale nu au fost suficient studiate în întreaga arie geografică a speciei, iar datele disponibile se bazează în principal pe secvențierea parțială a genelor. În acest studiu, am explorat diversitatea genetică a secvenței complete de 1560 bp a subunității 1 a subunității 1 a citocromului c oxidazei (cox1) a genei pentru populațiile de C. sinensis izolate din punct de vedere geografic în Rusia și Vietnam, pentru prima dată după cunoștințele noastre. Rezultatele au demonstrat o diferențiere redusă a nucleotidelor și o diferențiere ridicată a haplotipurilor în interiorul și între cele două regiuni comparate și un vector geografic clar pentru distribuția modelelor de diversitate genetică între populațiile studiate. Aceste rezultate sugerează o adaptare locală profundă a parazitului la mediul său, inclusiv la gazdele intermediare, precum și existența unui flux genetic în toată zona de răspândire a speciei. În plus, am prezis o substituție de aminoacizi în situsul funcțional al proteinei COX1 în rândul populațiilor vietnameze, care au fost raportate ca fiind dificil de tratat cu praziquantel. Rețelele de haplotipuri au constat în mai multe linii filogenetice specifice regiunii, a căror formare ar fi putut avea loc în timpul celor mai extinse penultime glaciațiuni din epoca pleistocenă. Modelele de diversitate genetică și demografie sunt în concordanță cu creșterea populației de fluke hepatic în Pleistocenul târziu, după Ultimul Maxim Glaciar, indicând lipsa unui blocaj al populației în timpul trecutului recent din istoria speciei. Datele obținute au implicații importante pentru înțelegerea filogeografiei lui C. sinensis, a interacțiunilor gazdă-parazit, a capacității acestui parazit de a evolua rezistența la medicamente și a epidemiologiei clonorhiozei în contextul schimbărilor climatice globale.
