Clasificare În cea mai largă circumscriere a licofitelor, grupul include zosterofilele dispărute, precum și licofitele existente (vii) și cele mai apropiate rude dispărute ale acestora. Denumirile și rangurile folosite pentru acest grup variază considerabil. Unele surse folosesc denumirile „Lycopodiophyta” sau mai scurt „Lycophyta” pentru a include zosterofilele, precum și lycofitele existente și cele mai apropiate rude dispărute ale acestora, în timp ce altele folosesc aceste denumiri pentru a exclude zosterofitele. Denumirea „Lycopodiophytina” a fost, de asemenea, utilizată în sens incluziv. Denumirile englezești, cum ar fi „lycophyte”, „lycopodiophyte” sau „lycopod”, sunt la fel de ambigue și se pot referi la grupul definit în sens larg sau doar la licofitele existente și la cele mai apropiate rude dispărute ale acestora. Clasificarea de consens produsă de clasificarea Pteridophyte Phylogeny Group în 2016 (PPG I) plasează toate lycofitele existente (în viață) în clasa Lycopodiopsida. Există aproximativ 1.290-1.340 de astfel de specii. Pentru mai multe informații despre clasificarea licofitelor existente, vezi .
Phylogeny Un studiu cladistic major al plantelor terestre a fost publicat în 1997 de Kenrick și Crane. În 2004, Crane et al. au publicat câteva cladograme simplificate, bazate pe o serie de figuri din Kenrick și Crane (1997). Cladograma lor pentru licofite este reprodusă mai jos (cu unele ramuri grupate în „grupuri bazale” pentru a reduce dimensiunea diagramei). Din acest punct de vedere, „zosterofilele” cuprind un grup parafilic, variind de la forme precum Hicklingia, care avea tulpini goale, până la forme precum Sawdonia și Nothia, ale căror tulpini sunt acoperite cu spini sau enațiuni nevascularizate. Genul Renalia ilustrează problemele legate de clasificarea primelor plante terestre. Acesta are caracteristici atât ale riniofitelor nelicofite – sporangii terminale mai degrabă decât laterale – cât și ale zosterofitelor – sporangii în formă de rinichi care se deschid de-a lungul marginii distale. Un punct de vedere destul de diferit este prezentat într-o analiză din 2013 de Hao și Xue. Cladograma preferată de aceștia prezintă zosterofilele și genurile asociate la baza atât a licopodiopsidelor, cât și a eufilofitelor, astfel încât nu există o cladă care să corespundă grupului de licofite definit în sens larg folosit de alți autori.
Câteva ordine dispărute de licofite se încadrează în același grup cu ordinele existente. Diferite surse folosesc numere și nume diferite ale ordinelor dispărute. Următoarea filogramă arată o relație probabilă între unele dintre ordinele Lycopodiopsida propuse.
.