Descriere
Promotoarele T7 pot produce niveluri ridicate de transcripție în E. coli atunci când este prezentă RNAP T7. Al doilea avantaj al promotorilor T7 este că nu sunt recunoscuți de RNAP E. coli, ceea ce face ca promotorii T7 să fie capabili de o reglare independentă față de promotorii E. coli. Având în vedere că un promotor T7 activ și puternic poate opri complet creșterea E. coli din cauza nivelului ridicat de consum de resurse (de exemplu, nucleotide) de către T7 RNAP, este necesar, de obicei, să se regleze nivelurile fie ale T7 RNAP, fie ale promotorului T7, fie ale ambelor. Ca atare, familia de promotori T7 conține atât promotori constitutivi, cât și promotori reglați negativ, care pot fi dezactivați de o proteină represoare. Cea mai frecventă tulpină celulară care se utilizează cu un sistem de promotori T7 este BL21(DE3), care este o tulpină B de E. coli care conține un lizogen λ cu o genă T7 RNAP inductibilă pe cromozom. Cu toate acestea, este posibil să se creeze multe alte tulpini de E. coli pentru a exprima condiționat T7 RNAP.
Obținerea colecției de promotori T7
Secvențele promotorilor T7 pot fi găsite în tabelul de mai jos. Pentru a obține ADN-ul fizic, se recomandă două abordări –
Via sinteză de novo: Deoarece promotorii sunt secvențe relativ scurte, acestea pot fi comandate sub forma a două oligoane monocatenare suprapuse care sunt aneantizate și extinse pentru a construi promotorii compleți. A se vedea acest protocol OpenWetWare cu privire la modul de construire a părților prin aneantizarea și extinderea oligo. Alternativ, promotorii pot fi comandați sub formă de gene scurte de la o companie precum Geneart.
Via Registry distribution: Unii dintre promotori sunt disponibili în distribuția actuală a registrului, a se vedea coloana de disponibilitate din tabelul de mai jos.
Design &Construcție
Logo-ul secvenței pentru promotorii puternici din genomul bacteriofagului T7.
Promotoarele T7 din colecție au fost proiectate și construite de mai multe grupuri diferite. Cu toate acestea, există doar T7 RNAP și, prin urmare, doar un singur tip de promotor T7. Secvența consensuală pentru promotorii T7 poate fi dedusă din logo-ul secvenței pentru promotorii T7 prezentat în dreapta.
Colecția de promotori T7
Nume | Descriere | Secvența promotorului | Regulatori pozitivi Regulatori |
Regulatori negativi Regulatori |
Negativi Regulatori |
Lungime | Doc | Status |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
BBa_I712074 | Promoter T7 (promotor puternic din bacteriofagul T7) | . . . agggaatacaagctactcttgttctttttgca | 46 | 1938 | În stoc | |||
BBa_I719005 | Promoter T7 | taatacgactcactatagggaga | 23 | 7912 | În stoc | |||
BBa_J34814 | Promoter T7 | gaatttaataatacgactcactatagggaga | 28 | 1190 | Nu este în stoc | |||
BBa_J64997 | T7 consensus -10 și restul | taatacgactcactatagg | 19 | 10154 | Este complicat | |||
BBa_K113010 | Suprapunerea promotorului T7 | . . gagtcgtattataatacgactcactatagggg | 40 | 1553 | Este complicat | |||
BBa_K113011 | mai mult promotor T7 suprapus | . . agtgagtcggtactactacgactcactatagggg | 37 | 1601 | Este complicat | |||
BBa_K113012 | Mai slabă suprapunere a promotorului T7 | . . gagtcggtattaatacgactctctctatagggg | 40 | 1630 | Este complicat | |||
BBa_K1614000 | Promoterul T7 pentru exprimarea ARN-ului funcțional | taatacgactcactatag | 18 | 5219 | În stoc | |||
BBa_K3511008 | C62-T7 promoter | taatacgactcacaatcgcggag | 23 | |||||
BBa_K3633015 | T7 promoter | taatacgactcactatagg | 19 | Este complicat | ||||
BBa_K525998 | Promoter T7 și RBS | . . . atacgactcactatagtagggaaagaggagaaa | 32 | 3036 | În stoc | |||
BBa_R0085 | T7 Consensus Promoter Sequence | taatacgactcactatagggaga | 23 | 2072 | În stoc | |||
BBa_R0180 | T7 RNAP promoter | ttatacgactcactatagtagggaga | 23 | 1654 | Nu este în stoc | |||
BBa_R0181 | T7 RNAP promoter | gaatacgactcactatagtagggaga | 23 | 1651 | Nu este în stoc | |||
BBa_R0182 | T7 RNAP promoter | taatacgtctcactatagggaga | 23 | 1653 | Nu este în stoc în stoc | |||
BBa_R0183 | T7 RNAP promoter | tcatacgactcactatagggaga | 23 | 1653 | Nu este în stoc | |||
BBa_R0184 | Promoter T7 (reprimabil lacI) | . . ataggggaattgtggagcggataacaattcc | 44 | 1176 | Nu este în stoc | |||
BBa_R0185 | Promoterul T7 (reprimabil lacI) | . . ataggggaattgtggagcggataacaattcc | 44 | 1888 | Nu este în stoc | |||
BBa_R0186 | Promoterul T7 (reprimabil lacI) | . . . . . ataggggaattgtgtgagcggataacaattcc | 44 | 1885 | Nu este în stoc | |||
BBa_R0187 | Promoterul T7 (reprimabil lacI) | . . ataggggaattgtggagcggataacaattcc | 44 | 1885 | Nu este în stoc | |||
BBa_Z0251 | Promoter T7 puternic | . . taatacgactcactatagtagggagaccacaac | 35 | 1887 | Nu este în stoc | |||
BBa_Z0252 | T7 legare slabă și procesivitate slabă | . . . . . taattgaactcacactaaagggagaccacagc | 35 | 1667 | Nu este în stoc | |||
BBa_Z0253 | T7 promotor de legare slabă | . . cgaagtaatacgactcactattagggaaga | 35 | 1400 | Nu este în stoc |
.