1935 publicerade Carrel en bok med titeln L’Homme, cet inconnu (Man, the Unknown), som blev en bästsäljare. I boken försökte han skissera en omfattande redogörelse för vad som är känt och framför allt okänt om människokroppen och det mänskliga livet ”i ljuset av upptäckter inom biologi, fysik och medicin”, för att belysa problem i den moderna världen och för att ge möjliga vägar till ett bättre liv för människan.
För Carrel var det grundläggande problemet att:
människor inte kan följa den moderna civilisationen längs dess nuvarande kurs, eftersom de degenererar. De har fascinerats av skönheten i vetenskaperna om inert materia. De har inte förstått att deras kropp och medvetande är underkastade naturlagar, mer obskyra än, men lika obevekliga som, lagarna i den sideriska världen. De har inte heller förstått att de inte kan överträda dessa lagar utan att straffas. De måste därför lära sig de nödvändiga relationerna mellan det kosmiska universumet, deras medmänniskor och deras inre jag, och även relationerna mellan deras vävnader och deras sinne. Människan står i själva verket över allting. Om han skulle degenerera skulle civilisationens skönhet och till och med det fysiska universums storslagenhet försvinna. … Mänsklighetens uppmärksamhet måste vända sig från maskinerna i den livlösa materiens värld till människans kropp och själ, till de organiska och mentala processer som har skapat Newtons och Einsteins maskiner och universum.
Carrell förespråkade delvis att mänskligheten skulle kunna förbättra sig själv genom att följa vägledningen från en elitgrupp av intellektuella, och genom att införliva eugenik i den sociala ramen. Han argumenterade för en aristokrati som utgår från individer med potential och skrev:
Vi måste välja ut de barn som är begåvade med höga potentialer och utveckla dem så fullständigt som möjligt. Och på detta sätt ge nationen en icke ärftlig aristokrati. Sådana barn kan finnas i alla samhällsklasser, även om framstående män förekommer oftare i framstående familjer än i andra. Efterkommande till den amerikanska civilisationens grundare kan fortfarande besitta de förfäderliga egenskaperna. Dessa egenskaper är i allmänhet dolda under degenerationens täckmantel. Men denna degeneration är ofta ytlig. Den kommer huvudsakligen från utbildning, sysslolöshet, brist på ansvar och moralisk disciplin. Söner till mycket rika män, liksom söner till brottslingar, bör avlägsnas från sin naturliga omgivning medan de fortfarande är spädbarn. På så sätt separerade från sin familj skulle de kunna manifestera sin ärftliga styrka. I Europas aristokratiska familjer finns också individer med stor vitalitet. Korsfararnas släkt är ingalunda utdöd. Genetikens lagar visar på sannolikheten att den legendariska djärvheten och äventyrslusten kan dyka upp igen i feodalherrarnas släkt. Det är också möjligt att avkomman till de stora brottslingar som hade fantasi, mod och omdöme, till hjältarna i den franska eller ryska revolutionen, till de högmodiga affärsmän som lever bland oss, skulle kunna vara utmärkta byggstenar för en företagsam minoritet. Som vi vet är brottslighet inte ärftlig om den inte är förenad med svagbegåvning eller andra mentala eller cerebrala defekter. Det är sällan man finner höga potentialer hos söner till ärliga, intelligenta, hårt arbetande män som har haft otur i sin karriär, som har misslyckats i affärer eller som hela livet har kämpat sig fram i underordnade positioner. Eller bland bönder som bott på samma plats i århundraden. Men från sådana människor kommer ibland konstnärer, poeter, äventyrare och helgon. En briljant begåvad och välkänd New York-familj kom från bönder som odlade sin gård i södra Frankrike från Karl den stores tid till Napoleons tid.
Carrel förespråkade eutanasi för brottslingar och kriminella sinnessjuka, och stödde särskilt användningen av gasning:
(t)e konditionering av småbrottslingar med piskan, eller något mer vetenskapligt förfarande, följt av en kortare sjukhusvistelse, skulle troligen räcka till för att säkerställa ordningen. De som har mördat, rånat medan de var beväpnade med automatpistol eller maskingevär, kidnappat barn, berövat de fattiga deras besparingar, vilselett allmänheten i viktiga frågor, bör på ett humant och ekonomiskt sätt avyttras i små eutanasiinstitutioner som förses med lämpliga gaser. En liknande behandling skulle med fördel kunna tillämpas på sinnessjuka som gjort sig skyldiga till brottsliga handlingar.
I övrigt stödde han frivillig positiv eugenik. Han skrev:
Vi har nämnt att det naturliga urvalet inte har spelat sin roll på länge. Att många mindervärdiga individer har bevarats genom hygienens och medicinens insatser. Men vi kan inte förhindra reproduktionen av de svaga när de varken är sinnessjuka eller kriminella. Eller förstöra sjuka eller defekta barn på samma sätt som vi gör med de svaga i en valpkull. Det enda sättet att undvika den katastrofala dominansen av de svaga är att utveckla de starka. Våra ansträngningar att göra de olämpliga normala är uppenbarligen meningslösa. Vi bör därför rikta vår uppmärksamhet mot att främja en optimal tillväxt av de lämpliga. Genom att göra de starka ännu starkare kan vi effektivt hjälpa de svaga; för flocken tjänar alltid på elitens idéer och uppfinningar. Istället för att utjämna organiska och mentala ojämlikheter bör vi förstärka dem och konstruera större människor.
Han fortsatte:
De starkares framsteg beror på villkoren för deras utveckling och den möjlighet som föräldrarna har att överföra de egenskaper som de har förvärvat under sin existens till sina avkommor. Det moderna samhället måste därför tillåta alla en viss stabilitet i livet, ett hem, en trädgård, några vänner. Barnen måste uppfostras i kontakt med saker som är ett uttryck för föräldrarnas tankar. Det är absolut nödvändigt att stoppa förvandlingen av jordbrukaren, hantverkaren, konstnären, professorn och vetenskapsmannen till manuella eller intellektuella proletärer som inte har något annat än sina händer eller sin hjärna. Utvecklingen av detta proletariat kommer att bli den industriella civilisationens eviga skam. Den har bidragit till familjens försvinnande som social enhet och till att intelligensen och den moraliska känslan försvagats. Den håller på att förstöra resterna av kulturen. Alla former av proletariatet måste undertryckas. Varje individ bör ha den trygghet och stabilitet som krävs för att grunda en familj. Äktenskapet måste upphöra att bara vara en tillfällig förening. Föreningen mellan man och kvinna, i likhet med de högre antropoiderna, bör åtminstone pågå till dess att ungarna inte längre har något behov av skydd. Lagstiftningen om utbildning, särskilt för flickor, om äktenskap och skilsmässa bör framför allt ta hänsyn till barnens intressen. Kvinnor bör få en högre utbildning, inte för att bli läkare, advokater eller professorer, utan för att uppfostra sina avkommor till värdefulla mänskliga varelser. eugenikens fria utövande skulle kunna leda inte bara till utveckling av starkare individer, utan också av stammar som är utrustade med mer uthållighet, intelligens och mod. Dessa stammar skulle utgöra en aristokrati, ur vilken stora män förmodligen skulle framträda. Det moderna samhället måste med alla tänkbara medel främja bildandet av en bättre mänsklig stam. Ingen ekonomisk eller moralisk belöning bör vara för stor för dem som genom ett klokt äktenskap skulle frambringa genier. Komplexiteten i vår civilisation är enorm. Ingen kan behärska alla dess mekanismer. Men dessa mekanismer måste behärskas. Det finns idag ett behov av män av större mental och moralisk storlek, som är kapabla att utföra en sådan uppgift. Inrättandet av en ärftlig biologisk aristokrati genom frivillig eugenik skulle vara ett viktigt steg mot lösningen av våra nuvarande problem.
Carrels stöd för eutanasi av kriminella och sinnessjuka publicerades i mitten av 1930-talet, före genomförandet av dödsläger och gaskamrar i Nazityskland. I den tyska inledningen av hans bok 1936 lade han på förlagets begäran till följande beröm av den nazistiska regimen som inte förekom i utgåvorna på andra språk:
(t)den tyska regeringen har vidtagit energiska åtgärder mot spridningen av defekta, psykiskt sjuka och kriminella. Den ideala lösningen skulle vara att förtrycka var och en av dessa individer så snart han har visat sig vara farlig.
Den lettiska översättningen av boken har tagits med på 1951 års lista över böcker som är förbjudna i Sovjetunionen.