Stedet er opført på National Register of Historic Places som USA’s første fabrik. De tidligste bygninger på stedet er blevet udpeget som et nationalt historisk landmærke. Selv om der fandtes mange fabrikker før Boston Manufacturing Company, var Francis Cabot Lowells fabrik den første, der kombinerede alle trin i fremstillingen af bomuldsstof under ét tag.
Waltham modtog et tilskud på 10 millioner dollars til byfornyelse, hvilket gjorde det muligt at renovere og bevare stedet. Som en del af renoveringen af stedet oprettede en gruppe af kultur-, borger- og erhvervsledere under ledelse af Michael Folsom, en MIT-professor, Charles River Museum of Industry & Innovation i det, der havde været møllens massive dampdrevne maskin- og kedelrum. Efter en monumental kampagne med indsamling af midler, rengøring, bygning, planlægning og installation blev museet taget i brug i 1980.
Museet er et nonprofit selskab, der styres af en bestyrelse og finansieres af private donationer.
Missionen for Charles River Museum of Industry & Innovation er at opmuntre og inspirere til fremtidig innovation i Amerika. Museet opnår dette gennem sine samlinger og programmer, ved at udforske industriens historiske indflydelse på den amerikanske kultur, ved at undersøge den dynamiske innovationsproces, ved at promovere sin beliggenhed i Waltham som et fundament for den amerikanske industrielle revolution, ved at forbinde ældre generationers ekspertise med unges nysgerrighed og ved at give publikum i alle aldre en engagerende museumsoplevelse.