Clonorchiasis er en parasitsygdom af stor betydning for folkesundheden i mange lande i det sydøstlige Asien og er forårsaget af den kinesiske leverorm Clonorchis sinensis. Den genetiske struktur og den demografiske historie for dens populationer er imidlertid ikke blevet undersøgt tilstrækkeligt i hele artens geografiske udbredelse, og de foreliggende data er hovedsagelig baseret på delvis gensekventering. I denne undersøgelse undersøgte vi den genetiske diversitet af den komplette cytochrom c oxidase subunit 1 (cox1)-gensekvens på 1560 bp for geografisk isolerede C. sinensis-populationer i Rusland og Vietnam, hvilket er første gang, vi har kendskab til. Resultaterne viste lav nukleotid- og høj haplotypedifferentiering inden for og mellem de to sammenlignede regioner og en klar geografisk vektor for fordelingen af de genetiske diversitetsmønstre blandt de undersøgte populationer. Disse resultater tyder på en dyb lokal tilpasning af parasitten til sit miljø, herunder mellemværter, og på eksistensen af genstrømme på tværs af artens udbredelsesområde. Desuden har vi forudsagt en aminosyresubstitution i det funktionelle sted for COX1-proteinet blandt de vietnamesiske populationer, som blev rapporteret som værende vanskelige at behandle med praziquantel. Haplotype-netværkene bestod af flere regionsspecifikke fylogenetiske slægtslinjer, hvis dannelse kunne være sket under de mest omfattende næstsidste istider i den pleistocæne epoke. Mønstrene for genetisk diversitet og demografi er i overensstemmelse med en befolkningsvækst af leverflåt i slutningen af Pleistocæn efter det sidste istidsmaksimum, hvilket tyder på, at der ikke har været en flaskehals i populationen i den seneste tid af artens historie. De opnåede data har vigtige implikationer for forståelsen af C. sinensis’ fylogeografi, dens vært-parasit-interaktioner, denne parasits evne til at udvikle lægemiddelresistens og klonorchiasis’ epidemiologi under globale klimaændringer.
