Guyots viser tegn på, at de engang har været over vandoverfladen, med en gradvis nedsynkning gennem stadier fra et bjerg med frynsede rev, en koralatol og til sidst et undervandsbjerg med en flad top. Seamounts er dannet ved ekstrudering af lava, der i etaper er ledt opad fra kilder i Jordens kappe, som regel hotspots, til udbrud på havbunden. Vulkanismen ophører uvægerligt efter et stykke tid, og andre processer dominerer. Når en undervulkan vokser så højt, at den er tæt på eller bryder havets overflade, har bølgepåvirkning og/eller koralrevets vækst tendens til at skabe en fladtoppet bygning. Alle havskorper og guyots dannes imidlertid af varm magma og/eller sten, som afkøles med tiden. Efterhånden som den litosfære, som den fremtidige guyot rider på, langsomt afkøles, bliver den tættere og synker dybere ned i Jordens kappe gennem isostaseprocessen. Desuden findes de erosive virkninger af bølger og strømme mest nær overfladen: toppen af guyots ligger generelt under denne zone med højere erosion.
Dette er den samme proces, der giver anledning til højere havbundstopografi ved oceaniske rygge, såsom den midtatlantiske ryg i Atlanterhavet, og dybere hav ved afgrundssletter og oceaniske grøfter, såsom Marianergraven. Den ø eller det grund, der i sidste ende bliver til en guyot, synker således langsomt ned over millioner af år. I de rette klimatiske områder kan koralvæksten nogle gange holde trit med nedsynkningen, hvilket resulterer i dannelsen af koralatoller, men til sidst synker korallerne for dybt ned til at vokse, og øen bliver en guyot. Jo længere tid der går, jo dybere bliver guyotterne.
Søer giver data om bevægelser af de tektoniske plader, som de ligger på, og om reologien i den underliggende litosfære. Tendensen i en seamountkæde sporer den litosfæriske plades bevægelsesretning over en mere eller mindre fast varmekilde i den underliggende asthenosfære, den del af Jordens kappe, der ligger under litosfæren. Man skønner, at der findes op til 50.000 undersøiske bjerge i Stillehavsområdet. Hawaii-Emperor seamount-kæden er et glimrende eksempel på en hel vulkankæde, der gennemgår denne proces, fra aktiv vulkanisme til koralrevsvækst, til dannelse af atoller, til nedsynkning af øerne og til at blive til guyots.