Klassifikation I den bredeste beskrivelse af lycofytter omfatter gruppen de uddøde zosterofytter samt de nulevende (levende) lycofytter og deres nærmeste uddøde slægtninge. De navne og rangordninger, der anvendes for denne gruppe, varierer betydeligt. Nogle kilder bruger navnene “Lycopodiophyta” eller det kortere “Lycophyta” til at omfatte zosterophyller samt uddøde lycophytter og deres nærmeste uddøde slægtninge, mens andre bruger disse navne til at udelukke zosterophyller. Navnet “Lycopodiophytina” er også blevet brugt i den inkluderende betydning. Engelske navne som “lycophyte”, “lycopodiophyte” eller “lycopod” er ligeledes tvetydige og kan henvise til den bredt definerede gruppe eller kun til de nulevende lycophyter og deres nærmeste uddøde slægtninge. Den konsensusklassifikation, der blev udarbejdet af Pteridophyte Phylogeny Group klassifikation i 2016 (PPG I), placerer alle eksisterende (levende) lycophyter i klassen Lycopodiopsida. Der findes omkring 1 290 til 1 340 sådanne arter. For yderligere oplysninger om klassifikationen af eksisterende lycophytter, se .
Fylogeni En større kladistisk undersøgelse af landplanter blev offentliggjort i 1997 af Kenrick og Crane. I 2004 offentliggjorde Crane et al. nogle forenklede kladogrammer, der er baseret på en række figurer i Kenrick og Crane (1997). Deres kladogram for lycophyterne er gengivet nedenfor (med nogle grene sammenklappet til “basale grupper” for at reducere diagrammets størrelse). I dette synspunkt udgør “zosterofytterne” en parafyletisk gruppe, der spænder fra former som Hicklingia, der havde nøgne stængler, til former som Sawdonia og Nothia, hvis stængler er dækket af ikke-vaskulariserede pigge eller enationer. Slægten Renalia illustrerer problemerne med at klassificere de tidlige landplanter. Den har kendetegn både ved de ikke-lykofytiske rhyniofytter – terminale snarere end laterale sporangier – og ved zosterofyterne – nyreformede sporangier, der åbner sig langs den distale kant. En noget anderledes opfattelse præsenteres i en analyse fra 2013 af Hao og Xue. Deres foretrukne kladogram viser zosterophyllerne og tilknyttede slægter basalt i forhold til både lycopodiopsiderne og euphyllofytterne, således at der ikke findes nogen klade, der svarer til den bredt definerede gruppe af lycophytter, som andre forfattere anvender.
Nogle uddøde ordener af lycophytter falder i samme gruppe som de uddøde ordener. Forskellige kilder anvender varierende antal og navne på de uddøde ordener. Det følgende fylogram viser et sandsynligt forhold mellem nogle af de foreslåede Lycopodiopsida-ordner.
