En lang række kirker og grupper udviklede sig inden for New Thought-bevægelsen. Emma Curtis Hopkins kaldes “Lærernes lærer” på grund af det antal mennesker, som hun underviste, og som efterfølgende grundlagde grupper inden for New Thought-bevægelsen. Efter at have lært af Hopkins grundlagde Annie Rix Militz Home of Truth. En anden elev, Malinda E. Cramer, blev medstifter af Divine Science sammen med fru Bingham, som senere underviste Nona L. Brooks, som var medstifter af Divine Science sammen med Cramer. Charles og Myrtle Fillmore, som gik på Hopkins sammen, grundlagde senere Unity School of Christianity. Forfattere blev også undervist af Hopkins, bl.a. Dr. H. Emilie Cady, forfatter til Unity- lærebogen Lessons in Truth, Ella Wheeler Wilcox, New Thought-poet, og Elizabeth Towne. Langt senere kom Ernest Holmes, der etablerede Religious Science og grundlagde United Centers for Spiritual Living.
Enhedskirken er den største New Thought-kirke i dag med tusindvis af medlemmer rundt om i verden. Den blev dannet af familien Fillmore i 1891. Divine Science blev også grundlagt i slutningen af det 19. århundrede af Melinda Cramer og Nona Brooks. United Centers for Spiritual Living blev grundlagt af Ernest Holmes i 1927. En lignende organisation, Society for Jewish Science, blev oprindeligt udtænkt af rabbiner Alfred G. Moses i begyndelsen af 1900-tallet, men bevægelsen blev institutionaliseret i 1922 med rabbiner Morris Lichtenstein’s. New Thought-bevægelsen strækker sig over hele verden. Det største trossamfund uden for USA, Seicho-no-Ie, blev grundlagt i 1930 af Masaharu Taniguchi i Japan. I dag har den missioner over hele verden, herunder USA. Mindre kirker, herunder Home of Truth, der blev grundlagt i 1899 i Alameda, Californien, fortsætter med succes, ligesom Agape International Spiritual Center, en megakirke ledet af pastor Dr. Michael Beckwith i Los Angeles-området.
Der har eksisteret en række paraplyorganisationer for New Thought, herunder International New Thought Alliance, som eksisterede i en eller anden form allerede i 1899. Affiliated New Thought Network blev dannet i 1992 for at skabe en overordnet New Thought-organisation. Siden 1974 har Universal Foundation for Better Living været en samling af kristne New Thought-forsamlinger rundt om i verden. I New York City oprettede New Thought-ledere en paraplyorganisation kaldet League for the Larger Life (Ligaen for et større liv). Den eksisterede fra 1916 og frem til 1950’erne.
Der har været mange New Thought-skoler. Den mest berømte er måske Unity School of Christianity i Missouri, som blev grundlagt i begyndelsen af det 20. århundrede. Emerson Theological Institute har fungeret siden 1992. I begyndelsen af det 20. århundrede ledede Horatio Dresser en organisation kaldet School of Applied Metaphysics.
Psychiana var en postordrebevægelse, der blev drevet af Frank B. Robinson, som underviste i og spredte budskabet om New Thought gennem det amerikanske postvæsen.