Wallace-linjen (eller “Wallaces linje”) er en grænse, der adskiller økozonen i Asien og den australske økozone. Overgangszonen kaldes undertiden Wallacea.
Planter og dyr, der er beslægtet med asiatiske arter, findes mod nordvest. Australasiatiske arter findes hovedsageligt mod sydøst, med enkelte asiatiske arter. Linjen er opkaldt efter Alfred Russel Wallace, som bemærkede denne klare skillelinje under sine rejser gennem Ostindien i det 19. århundrede.
Linjen går gennem Indonesien mellem Borneo og Sulawesi (Celebes) og gennem Lombokstrædet mellem Bali (i vest) og Lombok (i øst).
Afstanden mellem Bali og Lombok er kun ca. 35 kilometer. Overraskende nok overholder udbredelsen af mange fuglearter denne linje, fordi mange fugle ikke krydser selv de mindste strækninger af åbent havvand. Nogle flagermus har udbredelser, der krydser Wallace-linjen, men andre pattedyr er generelt begrænset til den ene eller den anden side; en undtagelse er den krabbespisende makak. Andre grupper af planter og dyr viser forskellige mønstre, men det overordnede mønster er slående og rimeligt konsistent.
Udtrykket ‘Wallace’s Line’ blev første gang brugt af Huxley i 1868.