Die Pilz XIII erscheinen in der Final Mix-Version des Spiels, sobald die Welt, in der sie sich befinden, vollständig gesäubert wurde (dies schließt alle Besuche sowie den Sieg über Xemnas in The World That Never Was ein). Anstatt sie einfach zu bekämpfen, müssen sie durch die Erfüllung bestimmter Bedingungen befriedigt werden. Wenn man es gut genug macht, lassen sie Tranquility-Materialien und einige seltene Waffen fallen, bevor sie wieder verschwinden. Wenn man sie noch besser erfüllt, lassen sie noch mehr Materialien fallen und schießen ein Feuerwerk ab, das anzeigt, dass die letzte Bedingung in Jiminys Tagebuch erfüllt ist. Sie alle zu erfüllen ist eine der drei Voraussetzungen für die Goldkrone, neben den Bosskämpfen „Datenorganisation XIII“ und „Verweilender Wille“.
Nr. 1
Den Pilz Nr. 1 finden Sie im Wolkenkratzer der Erinnerung in der Welt, die nie war, und er repräsentiert die Nr. 1 der Organisation, Xemnas. Das Ziel dieser Mission scheint einfach zu sein, denn Sora muss innerhalb von 30 Sekunden 70 Treffer auf dem Pilz landen. Doch genau wie Xemnas kann der Pilz nicht direkt angegriffen werden, da er nur zurückschlägt und Zeit verliert. Um die Mission zu erfüllen, darfst du dich nicht ein einziges Mal von dem Pilz treffen lassen. Wenn er es doch tut, verlassen Sie das Spiel und kehren Sie zum Neustart zurück. Der Reaktionsbefehl „Umkehren“ scheint die naheliegendste Lösung zu sein, ist aber unzureichend, da der Pilz nur seine eigene Umkehrung ausführt und einen Zyklus auslöst, wenn Sora ihn nicht aufhält. Stattdessen muss man eine halbe Sekunde warten, nachdem der Umkehrbefehl erscheint, da er durch „Schnelles Gleiten“ ersetzt wird; „Schnelles Gleiten“ verwirrt den Pilz und ermöglicht es Sora, einige Treffer zu landen. Auch dies mag einfach erscheinen, aber das Timing ist entscheidend.
Nimm die Weisheitsform an, da die normale Kombo mit neun Treffern jedes Mal ausreicht, wenn du den Pilz unvorbereitet triffst; wenn du ihn öfter angreifst, wird er zurückschlagen und Zeit verlieren. Starten Sie das Duell und es beginnt mit einer Umkehrung. Anstatt auf das Erscheinen des Reaktionsbefehls zu warten, solltest du die Bewegungen des Pilzes beobachten. Drücke sofort, nachdem er seine Umkehrung beendet hat, 
für Quick Slide. Triff ihn mit einer Neun-Schläge-Kombo und er wird erneut eine Umkehrung ausführen. Wiederhole das Muster, bis du 70 Treffer gelandet hast. Hierfür brauchst du eine Menge Übung, denn es geht eigentlich nur darum, den Rhythmus der Bewegungen des Pilzes zu erkennen und dein Timing entsprechend anzupassen.
Nr. 2
Den Pilz Nr. 2 findest du auf dem Weihnachtsbaumplatz in Christmas Town und er repräsentiert die Nr. 2 der Organisation und Xemnas‘ rechte Hand, Xigbar. Das Ziel dieser Mission ist es, den Geschossen des Pilzes auszuweichen, indem man entweder blockt oder ausweicht, bis die Punktzahl 80 erreicht ist. Du kannst diese Aufgabe zwar auch mit den üblichen Mitteln bewältigen, z. B. mit Wachen oder Ausweichen aus der Luft, aber mit Final Form wird diese Aufgabe viel einfacher, da viele der Aktionen von Final Form (einschließlich Springen) Sora vor eingehenden Angriffen abschirmen. Beginne damit, den Pilz nach dem Start des Duells zu fixieren, und bereite dich auf einen Angriff vor, indem du springst und in einen stationären Gleitflug übergehst (
+ 
, ohne den Analogstick zu bewegen). Sora schwebt an Ort und Stelle, ohne den Boden zu berühren, solange du gedrückt hältst, und blockt alle eingehenden Angriffe ohne jegliche Anstrengung deinerseits ab – das heißt, solange du den Angriffen gegenüberstehst. Der Pilz neigt dazu, sich mit der Zeit auf dem Feld zu bewegen, also nimm dir die Zeit, deine Position neu zu justieren, bevor du dich der nächsten Reihe von Geschossen stellst.
Eine alternative Strategie ist es, Wächter/Reflega einzusetzen und Stitch zu beschwören. Wenn der Pilz Sora angreift, wird Stitch ihn mit seinen Waffen betäuben, bevor er einen zweiten Angriff ausführen kann, so dass Sora seine Position wieder einnehmen und zum Wachen oder zum Spammen von Reflexzaubern zurückkehren kann. Beide Strategien machen es viel einfacher, diesen Pilz zu besiegen, als es sein sollte.
Nr. 3
Der Pilz Nr. 3 befindet sich auf der Brücke vor dem Schloss der Bestie und stellt Xaldin dar. Das Ziel dieser Mission ist es, alle Kugeln einzusammeln, die der Pilz fallen lässt, während er über das Gebiet schwebt. Normalerweise bewegt er sich langsam und lässt nur ein paar Kugeln auf einmal fallen, aber gelegentlich wird er schneller und lässt eine große Gruppe von Kugeln fallen. Achte darauf, dass du ein gutes Stück von jeder dieser großen Gruppen abbekommst, denn sie sind die wichtigsten, die du sammeln musst, um die erforderliche Punktzahl von 450 zu erreichen.
Rüste Sora mit der „Folge dem Wind“-Schlüsselklinge aus, die du in Port Royal erhalten hast, mit der Fähigkeit „Ziehen“ (so viele, wie ihm zur Verfügung stehen) und mit den Ziehringen (die du im 100-Acre-Wald bei Rabbit’s House finden kannst und die eine Belohnung für das Abschließen des Dualitätsrätsels in Form des Rezepts für das Seltene Dokument sind, das synthetisiert werden muss). Du kannst nun entweder Gleiten, Schnelllauf oder eine Kombination aus beidem benutzen, um dem Pilz so schnell wie möglich zu folgen; das ist auch nötig, denn die Kugeln verschwinden nach kurzer Zeit. Es kann notwendig sein, in die Weisheits- oder Endform zu gehen, um Schnelllauf und Gleiten auf der höchsten Stufe zu nutzen, was allerdings den Preis hat, dass man die andere Fähigkeit nicht nutzen kann. In diesem Fall ist Gleiten zwar schneller, aber Schnelllauf wird empfohlen, da Sora alle Kugeln erreichen kann, die auf den Boden fallen (bei Gleiten muss man dem Pilz näher folgen, da Sora die Kugeln erreichen muss, bevor sie auf den Boden fallen).
Nr. 4
Pilz Nr. 4 kann an den Palasttoren im Land der Drachen gefunden werden und repräsentiert Vexen. Das Ziel dieser Mission ist es, 85 der Klone des Pilzes zu besiegen (die mit einem Treffer zerstört werden können), ohne selbst getroffen zu werden. Die Pilze spawnen ständig und schubweise im ganzen Gebiet, was diese Mission vielleicht etwas einschüchternd erscheinen lässt. Mit der richtigen Strategie ist Nr. 4 jedoch einer der leichter zu besiegenden Pilze.
Wie bei vielen anderen Pilzen auch, ist die Weisheitsform ein wichtiger Schlüssel, um diesen Pilz ohne Probleme zu besiegen. Nimm die Weisheitsform an und beginne dann das Duell. Bewege dich in einer kreisförmigen Bewegung durch die Arena und schieße dabei ununterbrochen. Da Sora in der Lage ist, aus der Entfernung zu schießen, während er mit angemessener Geschwindigkeit über den Boden gleitet, ist es nicht notwendig, anzuhalten, um einen der Pilze anzugreifen (und ihnen damit die Möglichkeit zu geben, zurückzuschlagen). Bewege dich einfach am Rand der Arena entlang, während du schießt, und halte Abstand, bis du 85 erreichst.
Nr. 5
Pilz Nr. 5 kann in der Schatzkammer der Höhlenwunder in Agrabah gefunden werden und stellt Lexaeus dar. Das Ziel dieser Mission ist es, dem Pilz innerhalb von 10 Sekunden die Gesundheit zu entziehen, die dann kontinuierlich wiederhergestellt wird. Die Geschwindigkeit der Angriffe, mit denen ihr ihn besiegt, muss schneller sein als die Geschwindigkeit, mit der sich der Pilz selbst heilt, und auch die Zeit muss besser sein als die Uhr. Auch dies mag wie eine schwierige Aufgabe erscheinen, aber es gibt tatsächlich eine sehr einfache Strategie, um ihn zu besiegen.
Beginne damit, deine stärksten Keyblades auszurüsten, eines für Sora und eines für den zweiten Keyblade-Slot von Final Form. Als Nächstes füllst du Soras Gegenstandsslots mit allen möglichen billigen Gegenständen, die dir nichts ausmachen, wie Tränke oder Äther (an diesem Punkt des Spiels sollten sich Elixiere als viel nützlicher erweisen). Stellen Sie sicher, dass Sie sie auf eine Abkürzung setzen, um Zeit zu sparen. Nimm die Endform an und beginne das Duell. Bleiben Sie in der Nähe des Pilzes und verwenden Sie den Gegenstand, den Sie auf Ihren Gegenstandsslots und der Abkürzung eingestellt haben. Der Schaden, der durch die Verwendung von Gegenständen in Final Form verursacht wird, ist erstaunlich hoch und sollte das Ziel viel schneller erreichen als jede normale Combo in Final Form.
Nr. 6
Pilz Nr. 6 kann im Atrium der Unterwelthöhlen im Olympus-Kolosseum gefunden werden und stellt Zexion dar. Wie Zexion in Chain of Memories erzeugt auch dieser Pilz schwächere Klone von sich selbst, die überall in der Arena erscheinen. Diese Klone erscheinen in Gruppen und müssen alle innerhalb von 45 Sekunden besiegt werden. Wie bei Nr. 4 und Nr. 5 scheint es nur auf den ersten Blick eine schwierige Aufgabe zu sein, diesen Pilz zu besiegen. Mit der richtigen Strategie ist auch dieser Pilz leicht zu besiegen.
Magie zu benutzen ist der effizienteste Weg, um alle Klone von jeder Position aus zu zerstören, aber selbst Soras stärkste Zauber reichen nicht aus, um alle rechtzeitig zu erreichen. Abhilfe schafft die Endform, da Soras Magie dadurch deutlich an Reichweite und Stärke gewinnt. Nimm die Endform an und beginne dann das Duell. Zielt auf die Pilze, wo auch immer sie sich befinden, und setzt Thundaga ein, während ihr euch auf sie zubewegt. Mit Thundaga muss Sora nicht nahe genug an seinen Feinden sein, damit der Zauber sie trifft (wie mit Firaga), und er muss nicht zielen (wie mit Blizzaga), was es zu eurer besten Option macht. Wenn diese Pilze zerstört sind, suchen Sie die nächste Gruppe und setzen Sie erneut Thundaga ein. Wiederhole den Vorgang, bis alle Pilze besiegt sind, was innerhalb des Zeitlimits ohne Probleme möglich sein sollte.
Nr. 7
Pilz Nr. 7 kann in den Tunnelgängen von Twilight Town gefunden werden, die sich nur beim dritten Besuch öffnen, und stellt Saïx dar. Wie Saïx ist der Pilz in der Lage, durchzudrehen und Sora zu verletzen, wenn er mit ihm in Berührung kommt. Das Ziel ist es, ihm innerhalb von 10 Sekunden alle Lebensenergie zu entziehen, um ihn zu besiegen und die Aufgabe zu lösen. Die Pilze sind nicht nur stark, sondern stoßen Sora auch zurück, wodurch er Zeit verliert. Aus diesem Grund ist es wichtig, sich von ihm fernzuhalten, was die Verwendung des Schussangriffs der Weisheitsform oder des Thundaga der Endform zu einer praktikablen Strategie macht. Die einfachste Strategie kann jedoch dazu führen, dass Sora einmal oder mehrmals vom Feind getroffen wird. Unabhängig davon ist es ein relativ einfacher Weg, Nr. 7 schnell zu besiegen, wenn du diese Strategie trotz aller Angriffe, die Sora zurückwerfen könnten, weiter anwendest.
Nimm die Endform an und beginne dann das Duell. Sobald es beginnt, wirf Reflega. Fahre damit fort, denn der Pilz wird weiter angreifen. Wenn Soras Reflega-Kombo zu Ende ist, ist er den Angriffen des Pilzes ausgesetzt und wird unweigerlich mindestens einmal von dem Pilz getroffen. Ignorieren Sie die Angriffe und spammen Sie weiter mit Reflega. Wenn du dies für den Rest des Kampfes tust, wirst du gerade genug Schaden verursachen, um den Pilz rechtzeitig zu besiegen, die Bedingung in Jiminys Tagebuch zu erfüllen und der Krone einen Schritt näher zu kommen.
Nr. 8
Der Pilz Nr. 8 befindet sich vor dem Turm, der mit dem Zug vom Hauptbahnhof von Twilight Town aus erreichbar ist (erst nach dem dritten Besuch verfügbar), und stellt Axel dar. Um diesen Pilz zu erfüllen, muss er jongliert werden, ohne den Boden zu berühren, und schließlich mindestens 85 Mal in die Luft geschleudert werden. Es gibt einige Strategien, um dies zu erreichen, wie z. B. die Weisheitsform, um ihn immer wieder in die Luft zu schießen, oder Luftkombos mit dem Horizontal Slash, aber da diese Strategien so wenig Spielraum für Fehler haben, ist der einfachste Weg die Verwendung der Meisterform und des Fatal Crest Keyblade. Fatal Crest wird freigeschaltet, indem man den Pokal der Schicksalsgöttin in der Unterwelt des Olymp-Kolosseums abräumt.
Rüste Fatal Crest als Soras Keyblade aus, da es Sora die Fähigkeit gibt, unbegrenzte Combos zu ketten sowie Berserk Charge, was Soras Stärke erhöht, während sich seine MP auflädt. Um dies zu erleichtern, benutze Curaga (da es alle MP verbraucht), nachdem du in die Meisterform gegangen bist. Beginnen Sie nun das Duell und verfolgen Sie den Pilz, wenn er in die Luft fliegt, und greifen Sie ihn im selben Moment an, um eine Luftkombo zu starten. Mit der Verwendung von Fatal Crest wird diese Luftkombo nicht enden, bis das Ziel erreicht ist, also stellen Sie sicher, dass Sie ihr bis 85 folgen, oder sie wird fallen gelassen und Sie müssen von vorne beginnen. Vergewissere dich, dass du vom Speicherpunkt im Turm zur Weltkarte zurückkehrst, bevor du die Meisterform verlierst, um deine Antriebsanzeige wiederherzustellen und zum nächsten Pilz zu gelangen.
No. 9
Pilz Nr. 9 kann am Burgtor der Hohlen Bastion gefunden werden, wo Demyx bekämpft wurde. Passenderweise steht die Nr. 9 für Demyx. Das Ziel dieser Mission ist es, den Pilz mit insgesamt 75 Treffern am Drehen zu halten. Dies wird erreicht, indem man ihn ohne Unterbrechung trifft, was mit verschiedenen Strategien möglich ist. Eine dieser Strategien ist der Einsatz der Fatal Crest Keyblade und ihrer Berserker-Fähigkeit. Wie bei Nr. 8 ist es möglich, eine starke Combo ohne Ende aneinanderzureihen, indem man Curaga benutzt, um Soras gesamte MP zu verbrauchen, bevor man das Duell beginnt, und dann mit einem Angriff von Fatal Crest beginnt. Die Horizontale Ladung ist bei dieser Strategie ebenfalls sehr nützlich.
Eine andere Strategie beinhaltet die Verwendung der Weisheitsform und ist etwas einfacher, da man dafür keine Änderungen an Soras Ausrüstung oder Fähigkeiten vornehmen muss. Nimm einfach die Weisheitsform an und beginne dann das Duell. Beginne damit, Thundaga zu wirken, bis Soras MP aufgebraucht ist, und schieße dann, um sie in Bewegung zu halten. Dies sollte ausreichen, um 75 Treffer zu erzielen.
Nr. 10
Pilz Nr. 10 kann in der Mondschein-Ecke der Isla de Muerta in Port Royal gefunden werden und stellt Luxord dar. Wie Luxord mischt er sich unter die Klone und erfordert, dass Sora ihn danach aufspürt. Er ist einer der lästigeren Pilze, da es keine Abkürzungen gibt, um ihn zu besiegen, sondern nur Tipps. Um ihn zu besiegen, muss man ihm innerhalb von 55 Sekunden die Lebensenergie entziehen, obwohl man erst die Möglichkeit hat, ihn anzugreifen, nachdem er sich gemischt hat.
Nimm zu Beginn die Endform an, da Sora dann in der Zeit, in der er angreifen kann, so viele Treffer wie möglich landen kann. Es erscheinen Klone des Pilzes, die alle über den Bildschirm fliegen und versuchen, Sora zu verwirren, damit er das Original verliert. Wenn Sie Schwierigkeiten haben, dem Pilz mit den Augen zu folgen, was durchaus möglich ist, bleiben Sie dicht am Bildschirm und halten Sie ständig inne. Wenn Sie jede Sekunde pausieren, können Sie die Bewegungen des Pilzes bis auf das Bild genau verfolgen. Außerdem solltest du, egal ob du eine Pause einlegst oder nicht, darauf achten, dass du Abstand hältst, wenn die Pilze zu schlurfen beginnen, da sie sich in Ecken außerhalb deiner Sichtweite bewegen können, wenn Sora nah genug ist. Glücklicherweise hast du umso mehr Zeit zum Angreifen, je öfter du den Pilz richtig (und nacheinander) auswählst, indem du ihn angreifst. Mit der Endform solltest du ihn nur dreimal richtig erraten müssen, um ihn zu besiegen.
Nr. 11
Pilz Nr. 11 kann am Wasserweg des Zeitlosen Flusses gefunden werden, der durch die Tür in der Halle des Ecksteins im Disney-Schloss zugänglich ist, und repräsentiert Marluxia. Wie Marluxia und der Trefferzähler, den er über Sora platziert, hat auch dieser Pilz einen Trefferzähler über seinem Kopf. Im Gegensatz zum Kampf mit Marluxia muss dieser Trefferzähler jedoch innerhalb der kurzen Zeitspanne von neunzehn Sekunden auf Null gebracht werden, was die Sache noch schwieriger macht. Glücklicherweise ist diese Herausforderung nicht annähernd so schwierig, wie sie scheint.
Rüste alle Finishing Plus-Fähigkeiten und das Rumbling Rose Keyblade (das seine eigene Finishing Plus-Fähigkeit hat) aus. Nimm die Weisheitsform an und beginne das Duell. Achte darauf, die ganze Zeit auf den Pilz zu schießen. Diese Strategie macht sich den Finisher der Weisheitsform zunutze, der mit seinen vielen Schüssen eine große Anzahl von Treffern verursacht. Es gibt noch andere Strategien, um diesen Pilz zu besiegen, aber diese ist die einfachste und verursacht mehr als genug Treffer innerhalb des Zeitlimits.
Nr. 12
Pilz Nr. 12 kann vor dem alten Herrenhaus außerhalb von Twilight Town gefunden werden und repräsentiert Larxene. Wie Nr. 1 und Nr. 10 ist er einer der schwierigeren Pilze, da es keine Abkürzungen gibt. Das Ziel dieser Mission ist es, alle Klone, die der Pilz in dem Gebiet hervorbringt, insgesamt 40 Klone, innerhalb des Zeitlimits zu besiegen. Dies erweist sich aufgrund der vielen Verstecke auf dem Feld hinter Säulen als schwierig. Achten Sie darauf, beide Seiten des Feldes sowie die Vordertüren des Herrenhauses und das Tor auf der anderen Seite nach Pilzen abzusuchen. Um jeden Pilz in kürzester Zeit zu treffen, funktioniert die Weisheitsform am besten.
Nimm die Weisheitsform an und starte dann das Duell. Benutze 
, um die Kamera auf alle Pilze in der Nähe zu richten und zu schießen. Bewege dich dabei um das Feld herum, um keine Pilze auf beiden Seiten des Feldes zu verpassen. Irgendwann beginnen die Pilze, höher in die Luft zu schweben; diese können nur aus der Ferne abgeschossen werden. Ignorieren Sie sie, um nach anderen Pilzen zu suchen, wenn diese Ihnen zu viele Probleme bereiten, da es sich als Zeitverschwendung erweisen könnte, für jeden dieser Pilze zurückzugehen. Diese Mission kann mehrere Versuche erfordern, um sie zu perfektionieren, aber da dies der letzte Pilz ist, der vor Nr. 13 zu erfüllen ist, sollte sich die Übung lohnen.
Nr. 13
Den Pilz Nr. 13 findet ihr im Großen Schlund der Hohlen Bastion, wo die Schlacht der 1000 Herzlosen stattfand, und stellt Roxas dar. Wenn du alle zwölf Pilze siehst, die dich in der Gegend anfeuern, erscheint ein Reaktionsbefehl zum Aufschauen, sobald du ins Scheinwerferlicht trittst. Benutze ihn, um Nr. 13 herabsteigen zu sehen. Benutze einen weiteren Reaktionsbefehl (denselben „Ready, Go!“-Reaktionsbefehl, der auch bei allen anderen Pilzduellen erscheint) und Nr. 13 wird dich mit dem Schlüsselblatt des Siegerbeweises und dem Friedensbeweis belohnen, was dich einen Schritt näher an die Goldkrone bringt, falls du sie noch nicht erhalten hast.