Genetic diversity of the Chinese liver fluke Clonorchis sinensis from Russia and Vietnam

Clonorchiasis on kansanterveydellisesti erittäin tärkeä loistauti monissa Kaakkois-Aasian maissa, ja sen aiheuttaa kiinalainen maksarutto Clonorchis sinensis. Sen populaatioiden geneettistä rakennetta ja demografista historiaa ei kuitenkaan ole tutkittu riittävästi koko lajin maantieteellisellä levinneisyysalueella, ja saatavilla olevat tiedot perustuvat pääasiassa osittaiseen geenisekvensointiin. Tässä tutkimuksessa selvitimme ensimmäistä kertaa tietojemme mukaan täydellisen 1560 bp:n sytokromi-c-oksidaasin 1. alayksikön (cox1) geenisekvenssin geneettistä monimuotoisuutta maantieteellisesti eristetyissä C. sinensis -populaatioissa Venäjällä ja Vietnamissa. Tulokset osoittivat alhaisen nukleotidieron ja suuren haplotyyppieron kahden vertailualueen sisällä ja niiden välillä sekä selkeän maantieteellisen vektorin geneettisen monimuotoisuuden jakautumiselle tutkittujen populaatioiden välillä. Nämä tulokset viittaavat loisen syvään paikalliseen sopeutumiseen ympäristöönsä, väli-isännät mukaan luettuina, ja geenivirran olemassaoloon koko lajin levinneisyysalueella. Lisäksi olemme ennustaneet aminohapposubstituution COX1-proteiinin toiminnallisessa paikassa vietnamilaisissa populaatioissa, joita on raportoitu olevan vaikea hoitaa pratsikvanteelilla. Haplotyyppiverkostot koostuivat useista aluekohtaisista fylogeneettisistä linjoista, joiden muodostuminen saattoi tapahtua pleistoseenikauden laajimpien toiseksi viimeisten jääkausien aikana. Geneettisen monimuotoisuuden ja demografian mallit ovat sopusoinnussa maksasääsken populaation kasvun kanssa pleistoseenin loppupuolella viimeisen jääkauden maksimin jälkeen, mikä osoittaa, ettei lajin lähimenneisyydessä ole ollut populaation pullonkaulaa. Saaduilla tiedoilla on merkittäviä vaikutuksia C. sinensis -loisen fylogeografian ymmärtämiseen, sen isännän ja loisen välisiin vuorovaikutussuhteisiin, tämän loisen kykyyn kehittää lääkeresistenssiä ja klonorkiasiksen epidemiologiaan globaalissa ilmastonmuutoksessa.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.