Guyotissa on merkkejä siitä, että se on joskus ollut pinnan yläpuolella, ja se on vähitellen vajonnut vaiheittain reunustetusta riuttovuoresta, koralliatolista ja lopulta tasakattoisesta vedenalaisesta vuoresta. Vuorijonot ovat syntyneet puristamalla laavoja, jotka kulkeutuvat vaiheittain ylöspäin maan vaipassa olevista lähteistä, yleensä kuumista pisteistä, merenpohjassa oleviin purkausaukkoihin. Vulkaaninen toiminta loppuu aina jonkin ajan kuluttua, ja muut prosessit ovat vallitsevia. Kun merenalainen tulivuori kasvaa niin korkeaksi, että se on lähellä meren pintaa tai rikkoo sen, aaltojen vaikutus ja/tai koralliriuttojen kasvu luovat yleensä tasakorkuisen rakennelman. Kaikki valtameren kuori ja guyot muodostuvat kuitenkin kuumasta magmasta ja/tai kivestä, joka jäähtyy ajan myötä. Kun litosfääri, jonka päällä tuleva guyot ratsastaa, jäähtyy hitaasti, se muuttuu tiheämmäksi ja vajoaa isostaasiprosessin kautta alemmas maan vaippaan. Lisäksi aaltojen ja virtausten eroosiovaikutukset ovat enimmäkseen lähellä pintaa: guyottien huiput sijaitsevat yleensä tämän korkeamman eroosiovyöhykkeen alapuolella.
Tämä on sama prosessi, joka synnyttää korkeamman merenpohjan pinnanmuodostuksen valtameriharjanteissa, kuten Atlantin valtameren Keski-Atlantin harjanteessa, ja syvemmän valtameren syvänteissä abyssiaalisilla tasangoilla ja valtameren vallihaudoissa, kuten Marianan vallihaudassa. Näin saari tai matalikko, josta lopulta tulee guyot, vajoaa hitaasti miljoonien vuosien kuluessa. Oikeilla ilmastoalueilla korallien kasvu voi joskus pysyä vajoamisen tahdissa, mikä johtaa koralliatellien muodostumiseen, mutta lopulta korallit vajoavat liian syvälle kasvaakseen, ja saaresta tulee guyot. Mitä enemmän aikaa kuluu, sitä syvemmälle guyotista tulee.
Seamountit antavat tietoa niiden tektonisten laattojen liikkeistä, joiden päällä ne kulkevat, ja niiden alla olevan litosfäärin reologiasta. Merivuori-ketjun suuntaus jäljittää litosfäärilaatan liikesuunnan sen alla olevassa astenosfäärissä, eli litosfäärin alapuolella olevassa maan vaipan osassa, olevan enemmän tai vähemmän kiinteän lämmönlähteen yli. Tyynenmeren altaassa uskotaan olevan arviolta jopa 50 000 merenalaista vuorijonoa. Havaiji-Imperor-saamuvuoriketju on erinomainen esimerkki siitä, että kokonainen tulivuoriketju käy läpi tämän prosessin aktiivisesta vulkanismista, koralliriuttojen kasvusta, atollien muodostumisesta, saarten vajoamisesta ja muuttumisesta guyoteiksi.