Wallacen linja (tai ”Wallacen linja”) on raja, joka erottaa Aasian ekovyöhykkeen ja Australasian ekovyöhykkeen toisistaan. Siirtymävyöhykettä kutsutaan joskus nimellä Wallacea.
Luoteessa esiintyy Aasian lajeihin liittyviä kasveja ja eläimiä. Australaasialaisia lajeja esiintyy pääasiassa kaakossa, ja joitakin aasialaisia lajeja. Linja on nimetty Alfred Russel Wallacen mukaan, joka huomasi tämän selvän rajalinjan matkoillaan Itä-Intiassa 1800-luvulla.
Linja kulkee Indonesian halki Borneon ja Sulawesin (Celebes) välillä sekä Lombokin salmen läpi Balin (lännessä) ja Lombokin (idässä) välillä.
Balin ja Lombokin välinen etäisyys on vain noin 35 kilometriä. Yllättävää kyllä, monien lintulajien levinneisyydet noudattavat linjaa, sillä monet linnut eivät ylitä pienintäkään avomeren vesialuetta. Joidenkin lepakoiden levinneisyys ylittää Wallace-viivan, mutta muiden nisäkkäiden levinneisyys rajoittuu yleensä jommallekummalle puolelle; poikkeuksena on rapusyöjämakakki. Muiden kasvi- ja eläinryhmien levinneisyyskuviot poikkeavat toisistaan, mutta kokonaiskuvio on silmiinpistävä ja kohtuullisen johdonmukainen.
Termiä ”Wallacen linja” käytti ensimmäisen kerran Huxley vuonna 1868.