De nombreuses églises et groupes se sont développés au sein du mouvement de la Nouvelle Pensée. Emma Curtis Hopkins est appelée « l’enseignante des enseignants » en raison du nombre de personnes à qui elle a enseigné et qui ont ensuite fondé des groupes au sein du mouvement de la Nouvelle Pensée. Après avoir appris de Hopkins, Annie Rix Militz a fondé le Home of Truth. Une autre élève, Malinda E. Cramer, est devenue cofondatrice de la Science Divine, avec Mme Bingham, qui a ensuite enseigné à Nona L. Brooks, cofondatrice de la Science Divine avec Cramer. Charles et Myrtle Fillmore, qui fréquentèrent Hopkins ensemble, fondèrent ensuite la Unity School of Christianity. Hopkins a également formé des auteurs, notamment le Dr H. Emilie Cady, auteur du manuel Unity Lessons in Truth, Ella Wheeler Wilcox, poète de la Nouvelle Pensée, et Elizabeth Towne. Considérablement plus tard, Ernest Holmes, qui a créé la Science religieuse et fondé les Centres unis pour la vie spirituelle.
L’Église de l’Unité est la plus grande église de la Nouvelle Pensée aujourd’hui, avec des milliers de membres dans le monde entier. Elle a été formée par les Fillmore en 1891. La Science divine a également été fondée à la fin du 19e siècle par Melinda Cramer et Nona Brooks. Le United Centers for Spiritual Living a été fondé par Ernest Holmes en 1927. Une organisation similaire, la Society for Jewish Science, conçue à l’origine par le rabbin Alfred G. Moses au début des années 1900, le mouvement s’est institutionnalisé en 1922 avec le rabbin Morris Lichtenstein. Le mouvement de la Nouvelle Pensée s’étend dans le monde entier. La plus grande dénomination en dehors des États-Unis, Seicho-no-Ie, a été fondée en 1930 par Masaharu Taniguchi au Japon. Aujourd’hui, elle a des missions dans le monde entier, y compris aux États-Unis. De plus petites églises, y compris le Home of Truth fondé en 1899 à Alameda, en Californie, continuent avec succès, tout comme l’Agape International Spiritual Center, une méga-église dirigée par le révérend Dr Michael Beckwith dans la région de Los Angeles.
Une variété d’organisations parapluie de la Nouvelle Pensée ont existé, y compris l’International New Thought Alliance, qui existait sous une certaine forme dès 1899. L’Affiliated New Thought Network a été créé en 1992 pour fournir une organisation globale de la Nouvelle Pensée. Depuis 1974, la Fondation universelle pour une vie meilleure est un rassemblement de congrégations chrétiennes de la Nouvelle Pensée dans le monde entier. À New York, les leaders de la Nouvelle Pensée ont créé une organisation faîtière appelée League for the Larger Life. Elle a duré de 1916 aux années 1950.
Il y a eu de nombreuses écoles de la Nouvelle Pensée. La plus célèbre est peut-être la Unity School of Christianity dans le Missouri, fondée au début du 20e siècle. L’Institut théologique Emerson fonctionne depuis 1992. Au tournant du 20e siècle, Horatio Dresser dirigeait une organisation appelée School of Applied Metaphysics.
Psychiana était une dénomination de vente par correspondance dirigée par Frank B. Robinson qui enseignait et diffusait la Nouvelle Pensée par le biais du service postal américain.