Guyots visar tecken på att de en gång har legat ovanför ytan, med en gradvis sänkning genom olika stadier från ett berg med fransiga rev, en korallatoll och slutligen ett undervattensberg med platt topp. Seamounts bildas genom extrudering av lava som i etapper leds uppåt från källor i jordens mantel, vanligen hotspots, till utsläppsplatser på havsbotten. Vulkanismen upphör alltid efter en tid och andra processer dominerar. När en undervattensvulkan växer tillräckligt högt för att vara nära eller bryta havsytan tenderar vågverkan och/eller korallrevets tillväxt att skapa en byggnad med platt topp. Alla havsskorpor och guyots bildas dock av varm magma och/eller sten som svalnar med tiden. När litosfären som den framtida guyot rider på långsamt svalnar blir den tätare och sjunker djupare ner i jordens mantel genom isostasiprocessen. Dessutom finns de erosiva effekterna av vågor och strömmar mestadels nära ytan: topparna på guyots ligger i allmänhet under denna zon med högre erosion.
Detta är samma process som ger upphov till högre topografi på havsbotten vid oceaniska ryggar, till exempel den mellanatlantiska ryggen i Atlanten, och djupare hav vid avgrundsslätter och oceaniska diken, till exempel Marianergraven. På så sätt sjunker den ö eller det grund som så småningom kommer att bli en guyot långsamt under miljontals år. I de rätta klimatområdena kan koralltillväxten ibland hålla jämna steg med sänkningen, vilket leder till att det bildas en korallatoll, men så småningom sjunker korallerna för djupt ner för att växa och ön blir en guyot. Ju längre tid som går, desto djupare blir guyots.
Sjöberg ger uppgifter om rörelser hos de tektoniska plattor som de ligger på och om reologin hos den underliggande litosfären. Trenden i en undervattenskedja spårar den litosfäriska plattans rörelseriktning över en mer eller mindre fast värmekälla i den underliggande asthenosfären, den del av jordens mantel som ligger under litosfären. Man räknar med att det finns upp till uppskattningsvis 50 000 undervattensbergskedjor i Stillahavsbäckenet. Hawaiian-Emperor seamount-kedjan är ett utmärkt exempel på en hel vulkanisk kedja som genomgår denna process, från aktiv vulkanism, till tillväxt av korallrev, till atollbildning, till nedsänkning av öarna och till att bli guyots.