Hypermedia kan utvecklas på flera olika sätt. Alla programmeringsverktyg kan användas för att skriva program som länkar data från interna variabler och noder för externa datafiler. Programvara för utveckling av multimedia som Adobe Flash, Adobe Director, Macromedia Authorware och MatchWare Mediator kan användas för att skapa fristående hypermediaapplikationer, med tonvikt på underhållningsinnehåll. Vissa databasprogram, t.ex. Visual FoxPro och FileMaker Developer, kan användas för att utveckla fristående hypermedietillämpningar, med tonvikt på innehållshantering inom utbildning och affärsverksamhet.
Hypermedietillämpningar kan utvecklas på inbäddade enheter för mobilindustrin och digital skyltning med hjälp av specifikationen för Scalable Vector Graphics (SVG) från W3C (World Wide Web Consortium). Programprogram, t.ex. Ikivo Animator och Inkscape, underlättar utvecklingen av hypermedieinnehåll baserat på SVG. Inbyggda enheter, t.ex. iPhone, har naturligt stöd för SVG-specifikationerna och kan användas för att skapa mobila och distribuerade hypermedietillämpningar.
Hyperlänkar kan också läggas till i datafiler med hjälp av de flesta affärsprogram via de begränsade funktioner för skript och hyperlänkar som finns inbyggda. Dokumentationsmjukvara, t.ex. Microsoft Office Suite och LibreOffice, tillåter hypertextlänkar till annat innehåll i samma fil, andra externa filer och URL-länkar till filer på externa filservrar. Om man vill lägga större vikt vid grafik och sidlayout kan man lägga till hyperlänkar med hjälp av de flesta moderna desktop publishing-verktyg. Detta inkluderar presentationsprogram som Microsoft PowerPoint och LibreOffice Impress, tilläggsprogram till program för layout av utskrifter som Quark Immedia och verktyg för att inkludera hyperlänkar i PDF-dokument, t.ex. Adobe InDesign för skapande och Adobe Acrobat för redigering. Hyper Publish är ett verktyg som är särskilt utformat och optimerat för hantering av hypermedia och hypertext. Alla HTML-redigerare kan användas för att skapa HTML-filer som är tillgängliga med alla webbläsare. Verktyg för CD/DVD-författare, t.ex. DVD Studio Pro, kan användas för att hyperlänka innehållet på DVD-skivor för DVD-spelare eller webblänkar när skivan spelas upp på en persondator som är ansluten till Internet.