1990年代から米国で急増した自閉症の理由は謎に包まれています。 自閉症を発症する個人にはおそらく遺伝的素因があるが、研究者は1つ以上の環境的誘因も必要であると疑っている。 そのひとつが、幼い子どもたちが受ける予防接種かもしれない。 2001年から2007年にかけて、アメリカの各州において、2歳までに推奨ワクチンを接種した子どもの割合と自閉症（AUT）または言語障害（SLI）の有病率との関係を、回帰分析を用いて、家族の所得と民族性をコントロールしながら調べた。 その結果、統計的に有意な正の関係が見出された。 推奨される予防接種を受けている子どもの割合が高いほど、AUTまたはSLIの有病率が高いことがわかった。 ワクチン接種が1％増加すると、AUTまたはSLIに罹患する子供が680人増加した。 ワクチン接種の割合は、他の障害や州の小児科医の数とは（統計的に）有意な関係がなかったので、親の行動や医療へのアクセスは結果に影響を及ぼさなかった。 この結果は、多くのワクチンから水銀が除去されたものの、他の原因物質がワクチンと自閉症を結びつけている可能性を示唆している。 ワクチンと自閉症の関係については、さらなる研究が必要である。
