Genetic diversity of Chinese liver fluke Clonorchis sinensis from Russia and Vietnam

Clonorchiasisは東南アジアの多くの国で公衆衛生上重要な寄生虫病で,Crownorchis sinensisによって引き起こされています. しかし,その集団の遺伝的構造と人口動態の歴史は,この種の地理的範囲全体にわたって十分に研究されておらず,利用可能なデータは主に部分的な遺伝子配列決定に基づいている。 本研究では、ロシアとベトナムの地理的に孤立したC. sinensis集団について、1560bpのチトクロームc酸化酵素サブユニット1(cox1)遺伝子の完全配列の遺伝的多様性を、我々の知る限り初めて明らかにした。 その結果、比較した2つの地域内および地域間で塩基配列が低く、ハプロタイプが高く分化しており、研究対象集団間の遺伝的多様性パターンの分布に明確な地理的ベクトルがあることが示された。 これらの結果は、中間宿主を含む環境に対する寄生虫の深い局所適応と、種の範囲を超えた遺伝子流動の存在を示唆しています。 さらに、プラジカンテルによる治療が困難であると報告されているベトナム人集団において、COX1タンパク質の機能部位にアミノ酸置換が存在することを予測した。 ハプロタイプネットワークはいくつかの地域特異的な系統樹からなり、その形成は更新世エポックの最も大規模な半乾燥氷河期に起こった可能性がある。 遺伝的多様性と人口動態のパターンは、最終氷期最盛期以降の更新世後期における肝吸虫の集団成長と一致し、本種の歴史において最近に集団ボトルネックがなかったことを示している。 得られたデータは、C. sinensisの系統地理学、宿主と寄生虫の相互作用、この寄生虫の薬剤耐性進化能力、地球規模の気候変動下でのクロノルキア症の疫学を理解する上で重要な意味を持つものである。

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