Guyots mostram evidência de ter estado uma vez acima da superfície, com subsidência gradual através de estágios de montanha de recife cercada, atol de coral, e finalmente uma montanha submersa de ponta plana. Os montes submarinos são feitos por extrusão de lavas canalizadas para cima em estágios a partir de fontes dentro do manto terrestre, geralmente hotspots, até respiradouros no fundo do mar. O vulcanismo cessa invariavelmente depois de um tempo, e outros processos dominam. Quando um vulcão submarino cresce suficientemente alto para estar perto ou romper a superfície do oceano, a ação das ondas e/ou o crescimento dos recifes de coral tendem a criar um edifício de ponta plana. No entanto, toda a crosta oceânica e guyots se formam a partir de magma quente e/ou rocha, que esfria com o tempo. À medida que a litosfera em que o guyot do futuro arrefece lentamente, torna-se mais densa e afunda-se no manto da Terra, através do processo de isóstase. Além disso, os efeitos erosivos das ondas e correntes são encontrados principalmente perto da superfície: os topos das guyots geralmente ficam abaixo desta zona de maior erosão.
Este é o mesmo processo que dá origem a topografia mais alta do fundo do mar nas cristas oceânicas, como a crista do Médio Atlântico no Oceano Atlântico, e oceanos mais profundos nas planícies abissais e trincheiras oceânicas, como a Fossa das Marianas. Assim, a ilha ou cardume que eventualmente se tornará um guyot subsidia lentamente ao longo de milhões de anos. Nas regiões climáticas certas, o crescimento dos corais pode por vezes acompanhar a subsidência, resultando na formação de atóis de coral, mas eventualmente os corais mergulham demasiado fundo para crescerem e a ilha torna-se um guyot. Quanto maior a quantidade de tempo que passa, mais profundo se torna ouyot.
Seamounts fornecem dados sobre os movimentos das placas tectônicas nas quais eles cavalgam, e sobre a reologia da litosfera subjacente. A tendência de uma cadeia de montanhas costeiras traça a direção do movimento da placa litosférica sobre uma fonte de calor mais ou menos fixa na astenosfera subjacente, a parte do manto da Terra sob a litosfera. Estima-se que haja até 50.000 montes submarinos na bacia do Pacífico. A cadeia montanhosa Havaía-Imperador é um excelente exemplo de toda uma cadeia vulcânica que passa por este processo, desde o vulcanismo activo, ao crescimento dos recifes de coral, à formação de atóis, à subsidência das ilhas e a tornar-se em guyots.