Wallace-linjen (eller ”Wallace’s Line”) är en gräns som skiljer den asiatiska ekozonen från den australiensiska ekozonen. Övergångszonen kallas ibland Wallacea.
Plantor och djur som är besläktade med asiatiska arter finns i nordväst. Australasiatiska arter finns främst i sydost, med några asiatiska arter. Linjen är uppkallad efter Alfred Russel Wallace, som lade märke till denna tydliga skiljelinje under sina resor genom Ostindien på 1800-talet.
Linjen går genom Indonesien, mellan Borneo och Sulawesi (Celebes), och genom Lombok-sundet mellan Bali (i väster) och Lombok (i öster).
Avståndet mellan Bali och Lombok är endast cirka 35 kilometer. Överraskande nog följer många fågelarters utbredning linjen, eftersom många fåglar inte korsar ens de minsta sträckorna av öppet havsvatten. Vissa fladdermöss har utbredningar som korsar Wallace-linjen, men andra däggdjur är i allmänhet begränsade till den ena eller andra sidan; ett undantag är den krabbätande makaken. Andra grupper av växter och djur uppvisar olika mönster, men det övergripande mönstret är slående och någorlunda konsekvent.
Uttrycket ”Wallace’s Line” användes för första gången av Huxley 1868.