Diagnostika infekce salmonelou vyžaduje vyšetření vzorku, například stolice nebo krve. Testování může pomoci při rozhodování o léčbě.
Kroky laboratorního testování a hlášení infekce salmonelou
- Infekce je diagnostikována, když laboratorní test zjistí bakterie salmonely ve stolici, tělesné tkáni nebo tekutinách. Testem může být kultivace, která izoluje bakterie, nebo diagnostický test nezávislý na kultivaci (CIDT), který detekuje genetický materiál bakterií.
- CDC vyzývá laboratoře ke kultivaci vzorků s pozitivním výsledkem CIDT. Tento postup se nazývá „reflexní kultivace“.
- Klinické diagnostické laboratoře hlásí výsledky testů lékaři a předávají izoláty salmonel státním laboratořím veřejného zdraví k určení sérotypu a otisků DNA.
- Laboratoře veřejného zdravotnictví hlásí výsledky do laboratorního sledování střevních onemocnění CDC a do sítě PulseNet.
- Laboratoře veřejného zdravotnictví předávají neobvyklé sérotypy Národní referenční laboratoři pro salmonely CDC k další charakterizaci nebo potvrzení.
Sérotypy salmonel
Salmonely se dělí na sérotypy podle struktur na jejich povrchu.
Některé sérotypy se vyskytují pouze u jednoho druhu zvířat nebo na jednom místě. Jiné se vyskytují u mnoha různých zvířat a po celém světě. Několik sérotypů může způsobovat obzvláště závažná onemocnění; většina typicky způsobuje mírnější onemocnění.
Serotypizace hraje již po desetiletí důležitou roli v pochopení epidemiologické a molekulární charakteristiky salmonel. Moderní metody genetické subtypizace dnes vědcům poskytují další informace, které se používají k určení sérotypů a k identifikaci, vyšetřování a sledování ohnisek nákazy.
PulseNet
Státní laboratoře veřejného zdraví rutinně subtypizují izoláty salmonel pomocí sérotypizace a pomocí subtypizace založené na sekvenování celého genomu (WGS). Laboratoře zasílají výsledky sekvenování celého genomu do dynamické databáze spravované sítí PulseNet, což je národní síť laboratoří veřejného zdraví a potravinářských regulačních úřadů koordinovaná CDC.
PulseNet zahrnuje státní zdravotnické úřady, místní zdravotnické úřady, zemědělské laboratoře a federální úřady (CDC, Úřad pro bezpečnost a kontrolu potravin Ministerstva zemědělství USA a Úřad pro potraviny a léčiva USA.