La cadena de lagos incluye 13 cuerpos de agua y lleva el nombre de Whitefish Lake, el lago más grande del sistema. El lago Whitefish es un lago de flujo natural con una entrada y una salida del río Pine. El agua fluye hacia el sureste desde el lado oeste del lago Whitefish hacia un canal navegable que conecta con el lago Rush-Hen, y continúa hacia el sureste hasta desembocar en el lago Cross.
Muchos de estos lagos no estaban conectados originalmente, sino que se unieron después de 1886, cuando se completó la presa del río Pine en el lago Cross y se elevó el nivel del agua, creando canales permanentes entre los lagos. Algunos terrenos que originalmente eran penínsulas adyacentes a aguas abiertas se convirtieron en islas al aumentar el nivel del agua.
Aunque los lagos de la cadena Whitefish están conectados, diferencias como el tamaño del lago, la profundidad, el caudal y la gestión de las costas crean diferencias en los niveles de nutrientes y la claridad del agua entre los lagos. Los lagos varían en profundidad y estado trófico desde los poco profundos y eutróficos, como el lago Arrowhead, hasta los profundos y oligotróficos, como los lagos Big Trout e Island-Loon. La claridad del agua oscila entre los nueve pies de los lagos Little Pine, Daggett y Arrowhead y los 14 pies de los lagos Big Trout, Island-Loon y Lower Hay.
La cadena de lagos Whitefish es muy popular entre los aficionados (Knapp 2005). Aproximadamente el 91% del litoral de la cadena Whitefish es de propiedad privada y cuenta con unos 14 complejos turísticos. Existen seis accesos públicos en la cadena, situados en los lagos Lower Hay, Whitefish, Clamshell, Big Trout y Cross. La Sección de Pesca del DNR de Minnesota gestiona principalmente el lago Whitefish para la pesca del lucioperca y el lucio del norte. El lago Big Trout es el único lago de la zona de pesca de Brainerd que se gestiona y abastece de truchas.
La cadena Whitefish cubre una superficie de más de 14.000 acres y tiene una longitud total de costa de 115 millas. El lago Whitefish es el mayor de los 13 lagos y el segundo más grande de la cuenca del río Pine. Tiene una superficie de unos 7.715 acres y 32 millas de costa. Los lagos Loon, Island y Pig son los más pequeños de la cadena, cada uno con una superficie inferior a 200 acres.