De keten van meren omvat 13 waterlichamen en is genoemd naar Whitefish Lake, het grootste meer in het systeem. Whitefish Lake is een natuurlijk doorstroommeer met een inlaat van en uitlaat naar de Pine River. Het water stroomt van de westkant van Whitefish Lake naar het zuidoosten in een bevaarbaar kanaal dat aansluit op Rush-Hen Lake, en gaat verder naar het zuidoosten als het uitmondt in Cross Lake.
Vele van deze meren waren oorspronkelijk niet met elkaar verbonden, maar werden na 1886 samengevoegd toen de Pine River Dam bij Cross Lake werd
voltooid en het waterpeil verhoogde, waardoor permanente kanalen tussen de meren ontstonden. Sommige gebieden die oorspronkelijk als schiereilanden aan open water lagen, werden door het stijgende waterpeil omgevormd tot eilanden.
Hoewel de meren in de Whitefish Chain met elkaar verbonden zijn, zorgen verschillen zoals de grootte van het meer, de diepte, het debiet en het oeverbeheer voor verschillen in nutriëntenniveaus en helderheid van het water tussen de meren. Meren variëren in diepte en trofische status van ondiep en eutroof, zoals Arrowhead Lake, tot diep en oligotroof, zoals Big Trout en Island-Loon lakes. De helderheid van het water varieert van 9 voet in Little Pine, Daggett, en Arrowhead meren tot 14 voet in Big Trout, Island-Loon, en Lower Hay meren.
De Whitefish Chain of Lakes is populair bij recreanten (Knapp 2005). Ongeveer 91% van de oever van de Whitefish Chain is particulier bezit en telt ongeveer 14 resorts. Zes openbare toegangen zijn beschikbaar op de keten; ze bevinden zich op Lower Hay, Whitefish, Clamshell, Big Trout, en Cross lakes. De Minnesota DNR afdeling Visserij beheert voornamelijk Whitefish Lake voor walleye en northern pike. Big Trout Lake is het enige meer in het Brainerd Fisheries gebied dat wordt beheerd en uitgezet voor forel.
De Whitefish Chain beslaat een oppervlakte van meer dan 14.000 acres en heeft een totale oeverlengte van 115 mijl. Whitefish Lake is het grootste van de 13 meren en het op één na grootste in het Pine River stroomgebied. Het heeft een oppervlakte van ongeveer 7.715 acres en een oeverlijn van 32 mijl. Loon, Island en Pig lakes zijn de kleinste meren in de keten, elk met een oppervlakte van minder dan 200 acres.