La clonorchiasi è una malattia parassitaria di grande importanza per la salute pubblica in molti paesi del sud-est asiatico ed è causata dal coleottero cinese Clonorchis sinensis. Tuttavia, la struttura genetica e la storia demografica delle sue popolazioni non è stata sufficientemente studiata in tutta la gamma geografica della specie e i dati disponibili sono basati principalmente sul sequenziamento parziale del gene. In questo studio, abbiamo esplorato la diversità genetica della sequenza completa di 1560 bp del gene della citocromo c ossidasi subunità 1 (cox1) per le popolazioni di C. sinensis geograficamente isolate in Russia e Vietnam, a nostra conoscenza per la prima volta. I risultati hanno dimostrato una bassa differenziazione nucleotidica e alta differenziazione aplotipica all’interno e tra le due regioni confrontate e un chiaro vettore geografico per la distribuzione dei modelli di diversità genetica tra le popolazioni studiate. Questi risultati suggeriscono un profondo adattamento locale del parassita al suo ambiente, compresi gli ospiti intermedi, e l’esistenza di un flusso genico attraverso la gamma della specie. Inoltre, abbiamo predetto una sostituzione aminoacidica nel sito funzionale della proteina COX1 tra le popolazioni vietnamite, che sono state segnalate per essere difficili da trattare con praziquantel. Le reti di aplotipi consistevano in diversi lignaggi filogenetici specifici della regione, la cui formazione potrebbe essere avvenuta durante le penultime glaciazioni più estese dell’epoca pleistocenica. I modelli di diversità genetica e demografica sono coerenti con la crescita della popolazione del distoma epatico nel tardo Pleistocene dopo l’Ultimo Massimo Glaciale, indicando la mancanza di un collo di bottiglia della popolazione durante il recente passato nella storia della specie. I dati ottenuti hanno importanti implicazioni per la comprensione della filogeografia di C. sinensis, le sue interazioni ospite-parassita, la capacità di questo parassita di evolvere la resistenza ai farmaci, e l’epidemiologia della clonorchiasi sotto il cambiamento climatico globale.
