Hypermedia può essere sviluppato in diversi modi. Qualsiasi strumento di programmazione può essere usato per scrivere programmi che collegano dati da variabili interne e nodi per file di dati esterni. Software di sviluppo multimediale come Adobe Flash, Adobe Director, Macromedia Authorware, e MatchWare Mediator possono essere usati per creare applicazioni ipermediali indipendenti, con enfasi sul contenuto di intrattenimento. Alcuni software di database, come Visual FoxPro e FileMaker Developer, possono essere usati per sviluppare applicazioni ipermediali autonome, con enfasi sulla gestione dei contenuti educativi e aziendali.
Le applicazioni ipermediali possono essere sviluppate su dispositivi embedded per l’industria mobile e del digital signage usando le specifiche Scalable Vector Graphics (SVG) del W3C (World Wide Web Consortium). Applicazioni software, come Ikivo Animator e Inkscape, semplificano lo sviluppo di contenuti ipermediali basati su SVG. I dispositivi incorporati, come l’iPhone, supportano nativamente le specifiche SVG e possono essere usati per creare applicazioni ipermediali mobili e distribuite.
I collegamenti ipertestuali possono anche essere aggiunti ai file di dati usando la maggior parte dei software aziendali tramite le limitate funzioni di scripting e hyperlinking incorporate. I software di documentazione, come Microsoft Office Suite e LibreOffice, permettono collegamenti ipertestuali ad altri contenuti all’interno dello stesso file, ad altri file esterni, e collegamenti URL a file su file server esterni. Per una maggiore enfasi sulla grafica e sul layout di pagina, i collegamenti ipertestuali possono essere aggiunti utilizzando la maggior parte dei moderni strumenti di desktop publishing. Questo include programmi di presentazione, come Microsoft PowerPoint e LibreOffice Impress, componenti aggiuntivi per programmi di layout di stampa come Quark Immedia, e strumenti per includere collegamenti ipertestuali in documenti PDF come Adobe InDesign per la creazione e Adobe Acrobat per la modifica. Hyper Publish è uno strumento specificamente progettato e ottimizzato per la gestione di ipermedia e ipertesti. Qualsiasi editor HTML può essere usato per costruire file HTML, accessibili da qualsiasi browser web. Gli strumenti di authoring di CD/DVD, come DVD Studio Pro, possono essere usati per collegare in modo ipertestuale il contenuto dei DVD per i lettori DVD o i link web quando il disco viene riprodotto su un personal computer collegato a internet.