Classificazione Nella più ampia circoscrizione delle licofite, il gruppo comprende le zosterofile estinte così come le licofite estinte (viventi) e i loro parenti estinti più vicini. I nomi e i gradi usati per questo gruppo variano considerevolmente. Alcune fonti usano i nomi “Lycopodiophyta” o il più breve “Lycophyta” per includere le zosterofile così come le licofite estinte e i loro parenti estinti più prossimi, mentre altri usano questi nomi per escludere le zosterofile. Il nome “Lycopodiophytina” è stato anche usato in senso inclusivo. I nomi inglesi, come “lycophyte”, “lycopodiophyte” o “lycopod”, sono similmente ambigui, e possono riferirsi al gruppo ampiamente definito o solo alle licofite estinte e ai loro parenti estinti più prossimi. La classificazione di consenso prodotta dalla classificazione del Pteridophyte Phylogeny Group nel 2016 (PPG I) pone tutte le licofite esistenti (viventi) nella classe Lycopodiopsida. Ci sono circa 1.290-1.340 specie di questo tipo. Per ulteriori informazioni sulla classificazione delle licofite esistenti, vedere .
Filogenesi Un importante studio cladistico delle piante terrestri è stato pubblicato nel 1997 da Kenrick e Crane. Nel 2004, Crane et al. hanno pubblicato alcuni cladogrammi semplificati, basati su alcune figure di Kenrick e Crane (1997). Il loro cladogramma per le licofite è riprodotto qui sotto (con alcuni rami collassati in “gruppi basali” per ridurre le dimensioni del diagramma). In questa visione, le “zosterofite” comprendono un gruppo parafiletico, che va da forme come Hicklingia, che ha steli nudi, a forme come Sawdonia e Nothia, i cui steli sono coperti da spine o enazioni non vascolarizzate. Il genere Renalia illustra i problemi di classificazione delle prime piante terrestri. Ha caratteristiche sia delle rinofite non liofite – sporangi terminali piuttosto che laterali – che degli zosterofili – sporangi a forma di rene che si aprono lungo il margine distale. Una visione piuttosto diversa è presentata in un’analisi del 2013 da Hao e Xue. Il loro cladogramma preferito mostra gli zosterofili e i generi associati basali sia ai licopodiopsidi che alle euphyllophytes, in modo che non ci sia un clade corrispondente al gruppo ampiamente definito delle licofite usato da altri autori.
Alcuni ordini estinti di licofite rientrano nello stesso gruppo degli ordini esistenti. Fonti diverse usano numeri e nomi diversi degli ordini estinti. Il seguente filogramma mostra una probabile relazione tra alcuni degli ordini Lycopodiopsida proposti.
