Numerose chiese e gruppi si svilupparono all’interno del movimento del Nuovo Pensiero. Emma Curtis Hopkins è chiamata la “Maestra delle Maestre” per il numero di persone a cui ha insegnato e che hanno poi fondato gruppi all’interno del movimento del Nuovo Pensiero. Dopo aver imparato dalla Hopkins, Annie Rix Militz fondò la Home of Truth. Un’altra allieva, Malinda E. Cramer divenne cofondatrice della Scienza Divina, insieme alla signora Bingham, che in seguito insegnò a Nona L. Brooks, che cofondò la Scienza Divina con la Cramer. Charles e Myrtle Fillmore, che frequentarono insieme Hopkins, fondarono in seguito la Unity School of Christianity. Anche gli autori impararono da Hopkins, tra cui la dottoressa H. Emilie Cady, scrittrice del libro di testo Unity Lessons in Truth; Ella Wheeler Wilcox, poetessa del Nuovo Pensiero, ed Elizabeth Towne. Molto più tardi, Ernest Holmes, che stabilì la Scienza Religiosa e fondò i Centri Uniti per la Vita Spirituale.
La Chiesa dell’Unità è oggi la più grande chiesa del Nuovo Pensiero, con migliaia di membri in tutto il mondo. Fu formata dai Fillmore nel 1891. Anche la Scienza Divina fu fondata alla fine del XIX secolo da Melinda Cramer e Nona Brooks. Gli United Centers for Spiritual Living furono fondati da Ernest Holmes nel 1927. Un’organizzazione simile, la Society for Jewish Science, originariamente concepita dal rabbino Alfred G. Moses all’inizio del 1900, il movimento fu istituzionalizzato nel 1922 con il rabbino Morris Lichtenstein. Il movimento del Nuovo Pensiero si estende in tutto il mondo. La più grande denominazione fuori dagli Stati Uniti, Seicho-no-Ie, fu fondata nel 1930 da Masaharu Taniguchi in Giappone. Oggi ha missioni in tutto il mondo, compresi gli Stati Uniti. Chiese più piccole, tra cui la Home of Truth fondata nel 1899 ad Alameda, California, continuano con successo, così come l’Agape International Spiritual Center, una megachiesa guidata dal Rev. Dr. Michael Beckwith nell’area di Los Angeles.
Esistono una varietà di organizzazioni ombrello del Nuovo Pensiero, compresa l’International New Thought Alliance, che esisteva in qualche forma già nel 1899. L’Affiliated New Thought Network è stato formato nel 1992 per fornire un’organizzazione generale del Nuovo Pensiero. Dal 1974 la Universal Foundation for Better Living è stata un incontro di congregazioni cristiane del Nuovo Pensiero in tutto il mondo. A New York City, i leader del Nuovo Pensiero crearono un’organizzazione ombrello chiamata League for the Larger Life. Durò dal 1916 agli anni ’50.
Ci sono state molte scuole del Nuovo Pensiero. La più famosa può essere la Unity School of Christianity nel Missouri, fondata all’inizio del XX secolo. L’Istituto Teologico Emerson opera dal 1992. All’inizio del XX secolo Horatio Dresser dirigeva un’organizzazione chiamata Scuola di Metafisica Applicata.
Psychiana era una denominazione per corrispondenza gestita da Frank B. Robinson che insegnava e diffondeva il Nuovo Pensiero attraverso il servizio postale degli Stati Uniti.