Clonorchiasis is een parasitaire ziekte die van groot belang is voor de volksgezondheid in veel landen in Zuidoost-Azië en wordt veroorzaakt door de Chinese leverworm Clonorchis sinensis. De genetische structuur en de demografische geschiedenis van de populaties zijn echter niet voldoende bestudeerd in het hele geografische verspreidingsgebied van de soort en de beschikbare gegevens zijn voornamelijk gebaseerd op partiële gensequencing. In deze studie onderzochten wij de genetische diversiteit van de volledige 1560 bp cytochroom c oxidase subunit 1 (cox1) gensequentie voor geografisch geïsoleerde C. sinensis populaties in Rusland en Vietnam, voor zover wij weten voor het eerst. De resultaten toonden een lage nucleotide en hoge haplotype differentiatie binnen en tussen de twee vergeleken regio’s en een duidelijke geografische vector voor de verdeling van genetische diversiteitspatronen tussen de bestudeerde populaties. Deze resultaten suggereren een diepe lokale aanpassing van de parasiet aan zijn omgeving, inclusief tussengastheren en het bestaan van genenstroom over het verspreidingsgebied van de soort. Bovendien hebben we een aminozuursubstitutie voorspeld in de functionele site van het COX1-eiwit bij de Vietnamese populaties, die naar verluidt moeilijk te behandelen zijn met praziquantel. De haplotype-netwerken bestonden uit verschillende regio-specifieke fylogenetische lijnen, waarvan de vorming zou kunnen hebben plaatsgevonden tijdens de meest uitgebreide voorlaatste ijstijden in het Pleistoceen Tijdperk. De patronen van genetische diversiteit en demografie zijn consistent met populatiegroei van de leverfluim in het late Pleistoceen na het Laatste Glaciale Maximum, wat wijst op het ontbreken van een populatieknelpunt in het recente verleden in de geschiedenis van de soort. De verkregen gegevens hebben belangrijke implicaties voor het begrijpen van de fylogeografie van C. sinensis, zijn gastheer-parasiet interacties, het vermogen van deze parasiet om geneesmiddelenresistentie te evolueren, en de epidemiologie van clonorchiasis onder wereldwijde klimaatverandering.
