Onder de stukken die het museum tentoonstelt zijn:
- Het Pergamon Altaar
- Marktpoort van Miletus
- De Ishtar Poort en de Processieweg, Babylon
- De Mshatta Gevel
- Het Meissner fragment uit het Epos van Gilgamesj.
Verzameling van de Oudheid (Antikensammlung)
De verzameling gaat terug op de keurvorsten, of Kurfürsten, van Brandenburg, die voorwerpen uit de oudheid verzamelden; de verzameling begon met een aanwinst voor de verzameling door een Romeins archeoloog in 1698. Zij werd voor het eerst (gedeeltelijk) toegankelijk voor het publiek in 1830, toen het Altes Museum werd geopend. De collectie breidde zich sterk uit met de opgravingen in Olympia, Samos, Pergamon, Miletus, Priene, Magnesia, Cyprus en Didyma.
De collectie is verdeeld over het Pergamon Museum en het Altes Museum.
De collectie bevat beeldhouwwerk uit de archaïsche tot de hellenistische tijd, alsmede kunstwerken uit de Griekse en Romeinse oudheid: architectuur, beeldhouwwerken, inscripties, mozaïeken, bronzen, sieraden en aardewerk.
De belangrijkste tentoongestelde voorwerpen zijn het Pergamon Altaar uit de 2e eeuw v. Chr., met een 113 meter lang beeldhouwkundig fries dat de strijd tussen de goden en de reuzen voorstelt, en de Poort van Miletus uit de Romeinse oudheid.
Toen Duitsland na de Tweede Wereldoorlog werd opgedeeld, werd ook de collectie opgedeeld. Het Pergamon Museum werd in 1959 heropend in Oost-Berlijn, terwijl wat in West-Berlijn bleef, werd tentoongesteld in Schloss Charlottenburg.
Islamitisch Kunstmuseum (Museum für Islamische Kunst)
Bij de opening van het Bode Museum in 1904 werd een afdeling voor islamitische kunst gecreëerd, die later werd opgenomen in het Pergamon Museum (1950).
Naast islamitische kunstwerken uit de 8e tot de 19e eeuw, variërend van Spanje tot India, is de belangrijkste attractie de Mshatta façade, die afkomstig is van een onvoltooid vroeg-islamitisch woestijnpaleis, gelegen ten zuiden van Amman in het huidige Jordanië. Het was een geschenk van de Ottomaanse sultan Abdul Hamid II aan keizer Wilhelm II van Duitsland. Delen van het oostelijk deel van de gevel en de ruïnes van het bouwwerk waarvan het deel uitmaakte, zijn in Jordanië bewaard gebleven.
Een andere unieke tentoonstelling is de Aleppo-zaal. In dit deel van het museum is een ontvangstkamer uit een makelaarshuis in Aleppo, Syrië, te zien, die tijdens de Ottomaanse Periode in gebruik werd genomen.
Het Islamic Art Museum heeft ook regelmatig tijdelijke tentoonstellingen van moderne kunst uit de islamitische wereld, zoals in 2008 Turkish Delight (hedendaags Turks design) en Naqsh (Gender in Iranian Art and Society).
In 2008 werd een deel van de Keir Collection van Edmund de Unger, voorheen ondergebracht in zijn huis in Ham, Surrey, in langdurige bruikleen aan het museum gegeven voor een eerste periode van 15 jaar. Deze collectie is een van de belangrijkste naoorlogse privéverzamelingen van islamitische kunst en bestrijkt de hele islamitische wereld van de middeleeuwen tot de achttiende eeuw en omvat tapijten, textiel, verluchte handschriften, boekbanden, keramiek, metaalwerk en bergkristalobjecten.
Het Midden-Oostenmuseum (Vorderasiatisches Museum)
Het Midden-Oosten Museum tentoonstelling toont voorwerpen gevonden door Duitse archeologen en anderen uit de gebieden van de Assyrische, Sumerische en Babylonische cultuur. Daarnaast zijn er historische gebouwen, reliëfs en kleinere cultuurgoederen en sieraden te zien.
De belangrijkste tentoonstelling is de Ishtar Poort en de Processieweg van Babylon samen met de troonzaalgevel van Nebukadnezar II.
Het Vorderasiatisches Museum toont ook het Meissner fragment uit het Epos van Gilgamesj.