Juan Seguín, i sin fulde ordlyd Juan Nepomuceno Seguín, (født 27. oktober 1806 i Bexar, Ny Spanien – død 27. august 1890 i Nuevo Laredo, Mexico), tejano-revolutionær og politiker (texansk af latinamerikansk afstamning), som var med til at skabe Texas’ uafhængighed.
Når Mexico vandt uafhængighed fra Spanien i 1821, fik Stephen Austin – en ven af Seguíns far – mexicansk godkendelse til at grundlægge bosættelser af engelsktalende folk i det mexicanske område Texas. Seguín og hans far var overbevist om, at spansk-mexicansk uro og mexicansk regeringsindblanding var medvirkende til den økonomiske omvæltning i Texas, og de støttede Austin i hans efterfølgende søgen efter autonomi for regionen. Seguín blev aktiv i lokalpolitik, og han blev valgt til rådmand i San Antonio i 1829 og blev borgmester i byen i 1833. De politiske spændinger eskalerede mellem den mexicanske regering og både Anglos (amerikanske bosættere af europæisk afstamning eller europæiske indvandrere) og Tejanos i Texas, og begge grupper protesterede mod den mexicanske præsident Antonio López de Santa Annas hårde styre.
For at nedkæmpe det deraf følgende oprør i Texas trængte Santa Anna og hans tropper ind i territoriet og belejrede efterfølgende Alamo, en missionsfæstning i San Antonio, i februar 1836. Seguín befandt sig i Alamo, da belejringen begyndte, men han blev sendt af sted med et brev til Sam Houston, øverstkommanderende for de angloamerikanske bosætteres hær, hvor han bad om forstærkninger. Han var således fraværende, da næsten alle dem, der befandt sig i Alamo, blev dræbt af de mexicanske styrker den 6. marts 1836. Den følgende måned kæmpede Seguín og hans tejanotropper sammen med angloamerikanerne i slaget ved San Jacinto, som endte med nederlag og tilfangetagelse af Santa Anna og Texas’ uafhængighed.
I 1837 blev Seguín den første tejano til at sidde i republikken Texas’ senat, en stilling han besad indtil 1840, hvor han blev genvalgt som borgmester i San Antonio. På det tidspunkt var spændingerne mellem tejanoerne og det stadigt stigende antal angloamerikanere, der bosatte sig i Texas, vokset. Mange Anglos mistroede Tejanos – eller begærede simpelthen deres jord – og forsøgte at fjerne dem fra Texas’ territorium. Seguín blev til sidst beskyldt for at hjælpe den mexicanske regering med at forsøge at generobre Texas, og han blev tvunget til at flygte med sin familie til Mexico i 1842. Seguín blev af den mexicanske regering betragtet som en forræder for sin rolle i forbindelse med at vinde Texas’ uafhængighed og fik valget mellem en lang fængselsstraf eller tjeneste i den mexicanske hær. Han valgte det sidste, og han kæmpede mod USA i den mexicansk-amerikanske krig (1846-48).
Seguín vendte tilbage til Texas efter krigen og blev kvægavler; kort tid efter blev han valgt som lokal fredsdommer. Han boede i Texas indtil 1867, hvor en vedvarende amerikansk vrede tvang ham til en endelig flytning til Mexico, hvor han forblev indtil sin død. Byen Seguín, der ligger lige uden for San Antonio, er opkaldt til hans ære.