Juan Seguín, i sin helhet Juan Nepomuceno Seguín, (född 27 oktober 1806 i Bexar, Nya Spanien -död 27 augusti 1890 i Nuevo Laredo, Mexiko), tejano-revolutionär och politiker som bidrog till att göra Texas självständigt.
När Mexiko vann självständighet från Spanien 1821 fick Stephen Austin – en vän till Seguíns far – mexikanskt godkännande för att grunda bosättningar av engelsktalande människor i det mexikanska territoriet Texas. Seguín och hans far, som var övertygade om att spansk-mexikanska oroligheter och mexikansk regeringsinblandning bidrog till den ekonomiska omvälvningen i Texas, ställde sig på Austins sida i hans efterföljande strävan efter autonomi för regionen. Seguín blev aktiv i lokalpolitiken, och han valdes till rådman i San Antonio 1829 och blev stadens borgmästare 1833. De politiska spänningarna eskalerade mellan den mexikanska regeringen och både anglos (amerikanska bosättare med europeiskt ursprung eller europeiska invandrare) och tejanos i Texas, och båda grupperna protesterade mot den mexikanske presidenten Antonio López de Santa Annas hårda regim.
För att kväsa det uppror som följde i Texas gick Santa Anna och hans trupper in i territoriet och belägrade sedan Alamo, ett missionsfort i San Antonio, i februari 1836. Seguín befann sig i Alamo när belägringen inleddes, men han skickades med ett brev till Sam Houston, överbefälhavare för de angloamerikanska nybyggarnas armé, där han begärde förstärkningar. Han var alltså frånvarande när nästan alla som befann sig i Alamo dödades av de mexikanska styrkorna den 6 mars 1836. Följande månad kämpade Seguín och hans tejanotrupper tillsammans med anglosoldaterna i slaget vid San Jacinto, som slutade med att Santa Anna besegrades och tillfångatogs och att Texas blev självständigt.
År 1837 blev Seguín den förste tejano som fick tjänstgöra i Texas republikens senat, en position som han innehade fram till 1840, då han omvaldes till borgmästare i San Antonio. Vid den tiden hade spänningarna ökat mellan tejanos och det ständigt ökande antalet anglos som bosatte sig i Texas. Många angloamerikaner misstrodde tejanos – eller var helt enkelt sugna på deras mark – och försökte få bort dem från Texas territorium. Seguín anklagades så småningom för att hjälpa den mexikanska regeringen att försöka återerövra Texas, och han tvingades fly med sin familj till Mexiko 1842. Den mexikanska regeringen betraktade honom som en förrädare på grund av hans roll i att vinna Texas självständighet och Seguín fick välja mellan ett långt fängelsestraff eller tjänstgöring i den mexikanska armén. Han valde det sistnämnda och stred mot USA i det mexikansk-amerikanska kriget (1846-48).
Seguín återvände till Texas efter kriget och blev boskapsskötare; kort därefter valdes han till lokal fredsdomare. Han bodde i Texas fram till 1867, då en kvardröjande amerikansk förbittring tvingade honom att slutgiltigt flytta till Mexiko, där han stannade till sin död. Staden Seguín, som ligger strax utanför San Antonio, är uppkallad efter honom.