Die Seenkette umfasst 13 Gewässer und ist nach dem Whitefish Lake benannt, dem größten See des Systems. Der Whitefish Lake ist ein natürlicher Durchflusssee mit einem Zufluss vom und einem Abfluss zum Pine River. Das Wasser fließt in südöstlicher Richtung von der Westseite des Whitefish Lake in eine schiffbare Rinne, die sich mit dem Rush-Hen Lake verbindet und in südöstlicher Richtung in den Cross Lake mündet.
Viele dieser Seen waren ursprünglich nicht miteinander verbunden, sondern wurden nach 1886 zusammengelegt, als der Pine River Dam am Cross Lake fertiggestellt wurde und den Wasserstand anhob, wodurch dauerhafte Kanäle zwischen den Seen entstanden. Einige Ländereien, die ursprünglich als Halbinseln an das offene Wasser grenzten, wurden mit dem Anstieg des Wasserspiegels in Inseln umgewandelt.
Die Seen der Whitefish Chain sind zwar miteinander verbunden, aber Unterschiede wie die Größe der Seen, ihre Tiefe, die Strömung und die Bewirtschaftung der Ufergebiete führen zu Unterschieden im Nährstoffgehalt und der Klarheit des Wassers zwischen den Seen. Die Tiefe und der trophische Status der Seen reichen von flachen und eutrophen Seen wie dem Arrowhead Lake bis zu tiefen und oligotrophen Seen wie dem Big Trout und dem Island-Loon Lake. Die Klarheit des Wassers reicht von neun Fuß in Little Pine, Daggett und Arrowhead Lake bis zu 14 Fuß in Big Trout, Island-Loon und Lower Hay Lake.
Die Whitefish Chain of Lakes ist bei Erholungssuchenden beliebt (Knapp 2005). Etwa 91 % der Uferlinie der Whitefish Chain befinden sich in Privatbesitz und verfügen über etwa 14 Resorts. Sechs öffentliche Zugänge sind an der Kette vorhanden; sie befinden sich am Lower Hay, Whitefish, Clamshell, Big Trout und Cross Lake. Die Fischereibehörde von Minnesota DNR bewirtschaftet den Whitefish Lake in erster Linie für Zander und Hechte. Der Big Trout Lake ist der einzige See im Fischereigebiet von Brainerd, der mit Forellen bewirtschaftet und bestückt wird.
Die Whitefish Chain umfasst eine Fläche von über 14.000 Acres und hat eine Gesamtuferlänge von 115 Meilen. Der Whitefish Lake ist der größte der 13 Seen und der zweitgrößte im Wassereinzugsgebiet des Pine River. Er hat eine Fläche von etwa 7.715 Acres und eine Uferlänge von 32 Meilen. Loon, Island und Pig Lake sind die kleinsten Seen der Kette, die jeweils eine Fläche von weniger als 200 Hektar haben.