För att diagnostisera en salmonellainfektion måste man testa ett prov, t.ex. avföring (bajs) eller blod. Testning kan hjälpa till att vägleda behandlingsbeslut.
Steg i laboratorietestning och rapportering av salmonellainfektion
- Infektion diagnostiseras när ett laboratorietest påvisar salmonellabakterier i avföring, kroppsvävnad eller vätskor. Testet kan vara en odling som isolerar bakterien eller ett kulturoberoende diagnostiskt test (CIDT) som påvisar bakteriens genetiska material.
- CDC uppmuntrar laboratorier att odla prover med positiva CIDT-resultat. Denna process kallas ”reflexodling”.
- Kliniska diagnostiska laboratorier rapporterar testresultaten till läkaren och skickar Salmonellaisolat till statliga folkhälsolaboratorier för serotypning och DNA-fingerprinting.
- Folkhälsolaboratorier rapporterar resultaten till CDC:s laboratoriebaserade övervakning av enteriska sjukdomar och till PulseNet.
- Folkhälsolaboratorier vidarebefordrar ovanliga serotyper till CDC:s nationella referenslaboratorium för salmonella för ytterligare karakterisering eller bekräftelse.
Salmonella-serotyper
Salmonella delas in i serotyper enligt strukturer på deras yta.
Vissa serotyper finns bara hos en sorts djur eller på en enda plats. Andra finns hos många olika djur och över hela världen. Några få serotyper kan orsaka särskilt allvarliga sjukdomar; de flesta orsakar vanligen mildare sjukdomar.
Serotypning har under årtionden spelat en viktig roll för att förstå den epidemiologiska och molekylära karakteriseringen av Salmonella. I dag ger moderna genetiska subtypningsmetoder forskarna ytterligare information som används för att fastställa serotyper och för att identifiera, utreda och spåra utbrott.
PulseNet
Statliga folkhälsolaboratorier subtypar rutinmässigt Salmonella-isolat med hjälp av serotypning och med hjälp av subtypning baserad på sekvensering av hela arvsmassan (WGS). Laboratorierna skickar in resultaten från helgenomsekvensering till en dynamisk databas som underhålls av PulseNet, ett nationellt nätverk av laboratorier inom folkhälsa och livsmedelstillsyn som samordnas av CDC.
PulseNet omfattar delstatliga hälsovårdsavdelningar, lokala hälsovårdsavdelningar, jordbrukslaboratorier och federala organ (CDC, U.S. Department of Agriculture’s Food Safety and Inspection Service, och U.S. Food and Drug Administration.