Le diagnostic d’une infection à Salmonella nécessite de tester un spécimen (échantillon), tel que des selles (caca) ou du sang. Le test peut aider à orienter les décisions de traitement.
Étapes du test de laboratoire et du signalement d’une infection à Salmonella
- L’infection est diagnostiquée lorsqu’un test de laboratoire détecte la bactérie Salmonella dans les selles, les tissus corporels ou les fluides. Le test pourrait être une culture qui isole la bactérie ou un test de diagnostic indépendant de la culture (CIDT) qui détecte le matériel génétique de la bactérie.
- Le CCD encourage les laboratoires à mettre en culture les spécimens dont les résultats du CIDT sont positifs. Ce processus est appelé « mise en culture réflexe ».
- Les laboratoires de diagnostic clinique communiquent les résultats du test au médecin et soumettent les isolats de Salmonella aux laboratoires de santé publique des États pour le sérotypage et l’empreinte génétique.
- Les laboratoires de santé publique communiquent les résultats au Laboratory-based Enteric Disease Surveillance des CDC et à PulseNet.
- Les laboratoires de santé publique transmettent les sérotypes inhabituels au National Salmonella Reference Laboratory des CDC pour une caractérisation ou une confirmation plus poussée.
Sérotypes de Salmonella
Les salmonelles sont divisées en sérotypes selon les structures présentes à leur surface.
Certains sérotypes ne se retrouvent que dans un seul type d’animal ou dans un seul endroit. D’autres se retrouvent chez de nombreux animaux différents et dans le monde entier. Quelques sérotypes peuvent provoquer des maladies particulièrement graves ; la plupart provoquent généralement des maladies plus bénignes.
Le sérotypage joue un rôle important depuis des décennies dans la compréhension de la caractérisation épidémiologique et moléculaire de Salmonella. Aujourd’hui, les méthodes modernes de sous-typage génétique fournissent aux scientifiques des informations supplémentaires qui sont utilisées pour déterminer les sérotypes et pour identifier, enquêter et tracer les épidémies.
PulseNet
Les laboratoires de santé publique de l’État sous-typent régulièrement les isolats de Salmonella par sérotypage et par sous-typage basé sur le séquençage du génome entier (WGS). Les laboratoires soumettent les résultats du séquençage du génome entier à une base de données dynamique maintenue par PulseNet, un réseau national de laboratoires de santé publique et d’agences de réglementation alimentaire coordonné par le CDC.
PulseNet comprend des départements de santé des États, des départements de santé locaux, des laboratoires agricoles et des agences fédérales (CDC, le service de sécurité et d’inspection des aliments du ministère de l’Agriculture des États-Unis et la Food and Drug Administration des États-Unis.
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