Jackson ansåg att samkönade äktenskap och abort är moraliskt fel. Han trodde att abort och homoäktenskap orsakar den svarta familjens urholkning och sade: ”Jag känner inte till någon svart som säger: ’Jag hatar homosexuella människor’. Vi är mer accepterande i allmänhet. Men om du överlappar det – homosexualitet och homoäktenskap – med splittrade familjer vet vi inte hur vi ska få ihop dem igen”, sade han. ”Jag tror att Bibeln lär att samkönade äktenskap är en oxymoron”, sade han. ”Om man omdefinierar äktenskapet måste man omdefiniera familjen. Man måste omdefiniera föräldraskap. Jag ser på äktenskapets utrotning. Och den svarta kulturen är i fritt fall.”
Jackson var en framstående aktivist mot samkönade äktenskap och abort. Jackson började skriva om den svarta familjen i slutet av 1990-talet, och han fick ett nationellt erkännande genom sina kolumner i tidningen Charisma, där han ofta skrev om abort och homoäktenskap. År 2006 sade Jackson: ”’Det finns en hel del svarta kristna som kanske inte är republikaner men som delar liknande moraliska värderingar. Så jag vädjar till det faktum att mer än två miljoner svarta bebisar har gått förlorade på grund av abort under de senaste fyra åren och att över 70 procent av de svarta bebisarna föds av ogifta mödrar.””.
År 2009 började Jackson leda rörelsen mot legalisering av samkönade äktenskap i Washington, D.C. En grupp ledd av Jackson lämnade in en stämningsansökan i District of Columbia efter att D.C. Board of Elections vägrat att tillåta ett valinitiativ i frågan om samkönade äktenskap, med motiveringen att ett sådant initiativ skulle strida mot D.C.’s Human Rights Act (lagen om mänskliga rättigheter). I januari 2010 bekräftade D.C. Superior Court nämndens beslut. Jackson överklagade till D.C. Court of Appeals, men domstolen bekräftade överdomstolens beslut i en omröstning med 5-4 röster. Jackson överklagade sedan till USA:s högsta domstol, men överklagandet avslogs utan kommentar i januari 2011.
Jackson var grundare och ordförande för High Impact Leadership Coalition, en organisation som består av präster som aktivt främjar socialt konservativa frågor.
Jackson var också medgrundare av The Reconciled Church Initiative, som försöker få till stånd ett rashelande i kyrkan och Amerika.
Jackson instämde i påven Benedictus XVI:s övertygelse att kondomdistribution ökar förekomsten av aids. År 2009 skrev Jackson: ”Jag håller med påven om att en ansvarsfull och moralisk inställning till sex skulle hjälpa till att bekämpa sjukdomen.”
Jackson hävdade att vissa polisavdelningar borde få mindre pengar och uppmanade konservativa att inte förringa svarta mäns död i brottsbekämpningens förvar.
Enligt Christianity Today ”uppnådde Jackson sitt största inflytande i Donald Trumps Vita Hus, där han ofta deltog i tillställningar, bad offentligt och förespråkade politik som First Step Act, ett lagförslag om en fängelsereform som undertecknades som lag 2018. ’Du kan inte vara en profet för kulturen när du står utanför rummet’. Jackson sa som svar på kritiker.” Jackson bad vid Trumps invigning den 20 januari 2017 och besökte Vita huset vid flera tillfällen under Trumps administration.