サルモネラ感染症の診断には、便（ウンチ）や血液などの検体（サンプル）を検査することが必要です。 検査は治療方針の決定に役立ちます。
サルモネラ感染症の検査と報告の手順
- 検査室で便や体組織、体液からサルモネラ菌が検出されると、感染症と診断されます。 検査は細菌を分離する培養、または細菌の遺伝物質を検出する培養非依存性診断検査（CIDT）である。
- CDCは検査室でCIDT陽性結果を持つ検体を培養するよう勧めている。 このプロセスは「反射培養」と呼ばれている。
- 臨床診断研究所は検査結果を医師に報告し、血清型判定および DNA 指紋作成のためにサルモネラ分離菌を州の公衆衛生研究所に提出する。
- 公衆衛生研究所は、CDCのLaboratory-based Enteric Disease SurveillanceとPulseNetに結果を報告する。
- 公衆衛生研究所は、さらなる特性評価または確認のためにCDCのNational Salmonella Reference Laboratoryに珍しい血清型を転送する。
Salmonella Serotypes
サルモネラは表面の構造によって血清型に分けられます。 また、多くの種類の動物や世界中に存在するものもある。
Serotyping は、サルモネラの疫学的および分子的特徴を理解する上で、何十年にもわたって重要な役割を担ってきた。 今日、最新の遺伝子型別法は、血清型を決定し、アウトブレイクを特定、調査、追跡するために使用される追加情報を科学者に提供します。
PulseNet
州の公衆衛生研究所は、血清型別および全ゲノム配列解析 (WGS) ベースの型別によって、分離したサルモネラの亜型を定期的に決定しています。 各研究所は全ゲノム配列決定の結果を、CDC が調整する公衆衛生および食品規制機関の研究所の全国ネットワークである PulseNet が管理する動的データベースに提出する。
PulseNet には、州保健局、地方保健局、農業研究所、連邦機関（CDC、米国農務省の食品安全検査局、米国食品医薬品局。