A direktórium adminisztrációja
Az államháztartás teljes zűrzavarban volt. A kormányzat csak a külföldi országok fosztogatásaiból és adókból tudta fedezni kiadásait. A Direktórium folyamatosan háborúban állt külföldi koalíciókkal, amelyek között különböző időpontokban Nagy-Britannia, Ausztria, Poroszország, a Nápolyi Királyság, Oroszország és az Oszmán Birodalom is szerepelt. Elcsatolta Belgiumot és a Rajna bal partját, Bonaparte Napóleon pedig meghódította Olaszország nagy részét. A Direktórium hat rövid életű testvérköztársaságot hozott létre Franciaország mintájára Olaszországban, Svájcban és Hollandiában. A meghódított városoknak és államoknak hatalmas pénzösszegeket, valamint műkincseket kellett Franciaországba küldeniük, amelyekkel az új párizsi Louvre múzeumot töltötték meg. A Bonaparte vezette hadsereg meghódította Egyiptomot, és egészen a szíriai Saint-Jean-d’Acre-ig vonult. A Direktórium legyőzte a vendée-i háború kiújulását, a királypártiak által vezetett polgárháborút a Vendée régióban, de kudarcot vallott az 1798-as ír lázadás támogatására és az Ír Köztársaság megteremtésére irányuló vállalkozásában. A háborúk kimerítették az állami költségvetést, de ha békét kötnének, a hadseregek hazatérnének, és a direktóriumnak szembe kellene néznie a megélhetésüket elvesztett sorosok elkeseredésével és a tábornokok ambícióival, akik bármelyik pillanatban félresöpörhetnék őket.
A direktórium elítélte a rémuralom önkényes kivégzéseit, de nagyszabású törvénytelen elnyomásokat, sőt a civilek lemészárlását is végrehajtotta (Vendée-i háború). A gazdaság összeomlása és a magas élelmiszerárak különösen a szegényeket sújtották. Bár a Direktórium elkötelezett volt a republikanizmus mellett, bizalmatlan volt a létező, bár korlátozott demokráciával szemben. Amikor az 1798-as és 1799-es választásokat az ellenzék nyerte, a hadsereg segítségével bebörtönözte és száműzte az ellenzéki vezetőket, és bezáratta az ellenzéki újságokat. Kül- és belügyekben is egyre inkább a hadseregre támaszkodott, beleértve a pénzügyeket is. Barras és Rewbell köztudottan korruptak voltak, és másokban korrupciót szűrtek ki. Az igazgatók pártfogása rosszul járt, és az általános hivatali visszásságok fokozták népszerűtlenségüket.
Közéleti viszály
A Direktórium felállításával a korabeli megfigyelők azt hihették volna, hogy a forradalomnak vége. A háborútól megfáradt nemzet polgárai stabilitást, békét és az időnként a káosz határát súroló állapotok megszüntetését akarták. A jobboldaliak, akik XVIII. Lajos trónra ültetésével szerették volna visszaállítani a monarchiát, és a baloldaliak, akik megújították volna a rémuralmat, megpróbálták, de nem sikerült megdönteni a Direktóriumot. A korábbi atrocitások lehetetlenné tették a felek közötti bizalmat vagy jóakaratot.
Az új régime a baloldali jakobinusok és a jobboldali (a brit kormány által titokban támogatott) royalisták ellenállásába ütközött. A hadsereg elfojtotta a zavargásokat és az ellenforradalmi tevékenységet, de a lázadás és különösen Napóleon hatalmas hatalomra tett szert. Az 1797-es, a mandátumok egyharmadára kiírt választásokon a rojalisták szerezték meg a nagy többséget, és a következő választáson készen álltak arra, hogy átvegyék a Direktórium irányítását. A Direktórium erre úgy reagált, hogy a Fructidor 18-i puccsban minden győztest megtisztított, 57 vezetőt száműzött a biztos halálba Guyanába, és 42 újságot bezárt. Ezzel egyidejűleg elutasította a demokratikus választásokat, és megtartotta régi vezetőit a hatalomban.
A Napóleon által Olaszországból küldött Pierre Augereau és csapatai megrohamozzák a Tuileriákat, és elfogják Charles Pichegru és Willot tábornokokat. Az V. év Fructidor 18-i államcsíny (1797. szeptember 4.). Berthault metszete Girardet rajza alapján.
1797. szeptember 4-én, a hadsereggel a helyén, megindul a 18 Fructidor, V. év államcsínye. Augereau tábornok katonái letartóztatták Pichegru-t, Barthélemy-t és a tanácsok vezető royalista képviselőit. Másnap a Direktórium 53 megyében mintegy kétszáz képviselő választását érvénytelenítette. 65 képviselőt Guyanába deportáltak, 42 royalista újságot bezártak, és 65 újságírót és szerkesztőt deportáltak.
1799. november 9-én (VIII. év 18. Brumaire) Bonaparte Napóleon végrehajtotta a 18. brumaire-i puccsot, amely beiktatta a konzulátust. Ez gyakorlatilag Bonaparte diktatúrájához, majd 1804-ben császárrá való kikiáltásához vezetett. Ezzel véget ért a francia forradalom kifejezetten köztársasági szakasza.
A történészek a Direktóriumot inkább az önérdek, mint az erény kormányaként értékelték, amely elvesztette minden igényét az idealizmusra. Soha nem rendelkezett erős népi támogatottsággal. Amikor választásokat tartottak, a legtöbb jelöltje vereséget szenvedett. Eredményei csekélyek voltak, és a megközelítés a diktatúra felé való újabb fordulást és a liberális demokrácia kudarcát tükrözte. Az erőszak, az igazságszolgáltatás önkényes és kétes formái, valamint a durva elnyomás voltak a Direktórium által gyakran alkalmazott módszerek.