Administration av katalogen
Statens finanser var i totalt kaos. Regeringen kunde endast täcka sina utgifter genom plundring och tribut från främmande länder. Direktionen låg ständigt i krig med utländska koalitioner, som vid olika tidpunkter omfattade Storbritannien, Österrike, Preussen, kungariket Neapel, Ryssland och Osmanska riket. Det annekterade Belgien och Rhenens vänstra strand, medan Napoleon Bonaparte erövrade en stor del av Italien. Genom direktoratet upprättades sex kortlivade systerrepubliker med Frankrike som förebild i Italien, Schweiz och Nederländerna. De erövrade städerna och staterna var tvungna att skicka enorma summor pengar samt konstskatter till Frankrike, vilka användes för att fylla det nya Louvren-museet i Paris. En armé ledd av Bonaparte erövrade Egypten och marscherade så långt som till Saint-Jean-d’Acre i Syrien. Direktoriet besegrade en återuppståndelse av kriget i Vendée, det rojalistiskt ledda inbördeskriget i Vendée-regionen, men misslyckades i sin satsning på att stödja det irländska upproret 1798 och skapa en irländsk republik. Krigen uttömde statsbudgeten, men om fred slöts skulle arméerna återvända hem och direktörerna skulle tvingas möta exasperationen hos de vanliga medlemmarna som förlorat sin försörjning och ambitionen hos generaler som när som helst kunde avfärda dem.
Direktoriet fördömde de godtyckliga avrättningarna under skräckväldet men ägnade sig också åt storskaliga olagliga repressioner och till och med massakrer på civila (Kriget i Vendée). Den sviktande ekonomin och de höga livsmedelskostnaderna drabbade särskilt de fattiga. Även om direktoratet var engagerat i republikanism, misstrodde det den existerande, om än begränsade, demokratin. När oppositionen vann valen 1798 och 1799 använde den armén för att fängsla och landsförvisa oppositionsledare och stänga oppositionstidningar. Den blev också alltmer beroende av armén i utrikes- och inrikespolitiska frågor, inklusive finansiella frågor. Barras och Rewbell var notoriskt korrupta och granskade korruption hos andra. Direktörernas beskydd var illa skänkt och de allmänna missförhållandena i förvaltningen ökade deras impopularitet.
Offentlig oenighet
I och med upprättandet av direktoratet kunde samtida observatörer ha antagit att revolutionen var över. Medborgarna i den krigströtta nationen ville ha stabilitet, fred och ett slut på förhållanden som ibland gränsade till kaos. De som på högerkanten ville återupprätta monarkin genom att sätta Ludvig XVIII på tronen och de som på vänsterkanten ville återuppta skräckväldet försökte men misslyckades med att störta direktoratet. De tidigare grymheterna hade omöjliggjort förtroende eller god vilja mellan parterna.
Den nya regimen mötte motstånd från jakobiner till vänster och rojalister (i hemlighet subventionerade av den brittiska regeringen) till höger. Armén undertryckte upplopp och kontrarevolutionära aktiviteter, men upproret och i synnerhet Napoleon fick massiv makt. I valen 1797 om en tredjedel av platserna vann rojalisterna den stora majoriteten och var beredda att ta kontroll över direktoratet i nästa val. Direktoriet reagerade genom att rensa ut alla vinnare i kuppen den 18 Fructidor, förvisa 57 ledare till en säker död i Guyana och stänga 42 tidningar. På samma sätt förkastade den demokratiska val och behöll sina gamla ledare vid makten.
Pierre Augereau och hans trupper, som skickats av Napoleon från Italien, stormar Tuilerierna och tillfångatar generalerna Charles Pichegru och Willot. Statskupp den 18 Fructidor, år V (4 september 1797). Gravyr av Berthault efter en teckning av Girardet.
Den 4 september 1797, med armén på plats, sattes statskuppen 18 Fructidor, år V igång. General Augereaus soldater arresterade Pichegru, Barthélemy och de ledande rojalistiska deputerade i råden. Dagen därpå ogiltigförklarade direktionen valen av omkring tvåhundra deputerade i 53 departement. 65 deputerade deporterades till Guyana, 42 rojalistiska tidningar stängdes och 65 journalister och redaktörer deporterades.
Den 9 november 1799 (18 brumaire år VIII) iscensatte Napoleon Bonaparte kuppen 18 brumaire, som installerade konsulatet. Detta ledde i praktiken till Bonapartes diktatur och 1804 till att han utropades till kejsare. Detta avslutade den franska revolutionens specifikt republikanska fas.
Historiker har bedömt direktoratet som en regering av egenintresse snarare än dygd som förlorade varje anspråk på idealism. Den hade aldrig någon stark bas av folkligt stöd. När val hölls besegrades de flesta av dess kandidater. Dess framgångar var obetydliga och tillvägagångssättet återspeglade en ny vändning mot diktatur och den liberala demokratins misslyckande. Våld, godtyckliga och tveksamma former av rättvisa och hårdhänt förtryck var metoder som ofta användes av direktoratet.